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同学你好，请问你能找到pan-genome:v1.0这个镜像吗？我登上去发现镜像是空的

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老师您好，在做GWAS分析的时候，性状数据不是连续的数字，是0，1这种，这样的数据也可以按照上课讲的流程分析吗？性状数据没有多年数据，在后续的分析步骤中，不定义tassel_trait这个变量可以吗？

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服务器连接断网

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SoupX去除污染RNA

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重测序BWA比对率低

  • BJFU 2024-12-30 08:50
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运行go_enrich.r报错

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5 想请问安捷伦双通道芯片数据得到了cy5和cy3通道的数据，想要做一些其它的分析，请问可以单独提取cy5的数据吗？然后对cy5中的数据重新进行别的分析？比如细胞类型反卷积之类的

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blast比对得到的基因进行构树，无法与拟南芥基因进行聚类

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binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

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基因组组装着丝粒问题

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重测序

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老师您好，如何批量提取不同基因组中的同源基因家族成员

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老师 就是 您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传过滤的条件有一点不一样 那个才是对的或者两个都对 我截屏放一次下面啦 您看一下

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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我想请教一下16s高级扩增子分析中的，微生物共存网络的问题，在“确定物种间存在相互作用关系的阈值，将相关性R矩阵内不符合的数据转换为0”这步中，按照视频中给的代码进行操作后报错，原因是矩阵中有缺失值，请问这个缺失值如何处理，把他如何赋值为0？

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这个脚本如果直接从ensamble下载cds和pep还需要去提取吗，是不是可以直接转换格式

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重测序

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vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

  • Max 2024-12-21 21:52
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宏基因组预测后使用salmon计算物种丰度的TPM值可以直接相加吗？

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Use of uninitialized value $id in lc at /share/work/biosoft/perl/perl-5.22.1/lib/site_perl/5.22.1/AGAT/OmniscientI.pm会影响结果吗