好实验从一个好的样本命名开始！
常年混迹于生物测序行业，每天见的最多的是各种各样的生物样品，干的最多的就是区分样品，一千个样品有一千种命名方式：有用阿拉伯数字顺序下来的；有用汉字的；有名中带特殊字符的。殊不知，如此命名已经给你的实验埋下了隐忧。 我见过样品6/9不分的；O/0混淆的；有数字重复难以区分样品的；更有因样品名重新分析的。看得多了愈发感觉到样品命名的重要性。
下面我就再絮叨下样品命名几点注意事项，有需要的老师可以转发给您的研究生，好的实验是从一个好名字开始的！
1. 唯一性：
在同一批次或不同批次样品中不能出现相同或相近的命名，为避免不小心出现重复命名，尽量不要用纯数字当做样品名，以及注意以下几种情形：1). 字母“o”和数字“0”、字母“Z”和数字“2”在样本名称中不要同时出现， 小写字母"l”和数字“1”在样本名称中尽量不要同时出现，大写字母可区分；2). 小写字母“q”和数字“9”在样本名称中尽量不要同时出现，大写字母可区分。2. 完整性样品名应包含样本的基本信息比如：样本来源、处理方法、采样时间等信息，这样不仅便于自己梳理样品，也利于他人（试验人员、审稿人、读者）理解你的样品含义。如野生型(wild type）材料苗期（seedling stage）叶片（leaf）取三次生物学重复，可以用缩写：WT-S-L-1/2/3表示。3. 一致性一个实验，无论样本多少，所有样本都应遵循同一个命名规则，这样易于排查样品及理解数据结果。
4. 不要有特殊字符
由于生信分析系统和程序的要求，样品名称中不能有汉字，只能包含字母、数字和“-”，且不能以数字开头，名字长度不能超过8个字符；名称中不能有：罗马数字I、II、III、IV等及ASCII码中的空格、@、*、+、/、#、$、!、&、%、△、①、>、<等。样品命名看似小事一件，却在细节中影响着你的实验，尤其在样品数多、处理复杂的实验设计中，糟糕的样本命名极易造成样品缺失、重复以及数据可读性差；另外样本命名从一开始就应认真对待，一次性符合后期分析及发表文章的要求，这样可以避免后期更改命名的麻烦和匹配错误。
其实还有另一方面经常被我们忽略，样本命名不仅是自己能看明白，还要能让实验人员、数据分析人员，甚至审稿人、读你文章的人以及对你的实验感兴趣的人易于看明白；如此看来，样本科学的命名确实是一件非常重要的工作，是一项优秀的科学实验的开始！
小伙伴们，你是怎样对待样本命名的呢？希望你已习惯优秀！
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- 发表于 2020-01-08 22:16
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- 分类：基础知识
