BLINK（C版本） 进行 GWAS分析的教程
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- 星莓
- 发布于 2023-12-27 11:31
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星莓
Ti Amo
SURVIVOR工具进行结构变异结果文件的格式转换（bedtovcf）
结构变异结果文件格式转换工具——SURVIVOR
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- 每天学习一点点
- 发布于 2023-12-26 17:31
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每天学习一点点
R语言中转换成dummy dummy-variables 虚拟变量
转换成dummy dummy-variables
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- omicsgene
- 发布于 2023-12-21 15:11
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omicsgene
xun
安生水
rzx
GATK|Timeout of 30000 milliseconds was reached while trying to acquire a lock on file raw.vcf.tmp.idx.
解决办法：https://www.omicsclass.com/article/2194 这里还有一个需要做的步骤，就是先将raw.vcf.tmp.idx文件找到并删除，一般情况下这个文件是空的。 然后再在命令行中添加-disable_auto_in...
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- rzx
- 发布于 2023-12-15 10:23
- 阅读 ( 1686 )
37门付费精品课程免费送！（此链接微信中打开体验更好）
在这个科研内卷的年代，你没有好设备，没有好材料，没有充足经费，怎么立足？毕业、就业、发文、评职称，靠什么来实现？留给你破局的选择不多！！为此，我们组学大讲堂决定干一票大的！我们将永...
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- 生信老顽童
- 发布于 2023-12-14 11:31
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生信老顽童
SURVIVOR合并单样品SV出错
在做SV、CNV变异检测时，会使用SURVIVOR将不用样品的vcf文件合并到一起，命令如下： ls *.max.vcf >sample_files && /share/work/biosoft/SURVIVOR/SURVIVOR/Debug/SURVIVOR merge...
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- 安生水
- 发布于 2023-12-13 13:51
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InterProScan-蛋白质预测
InterProScan是InterPro数据库提供给用户的一个软件包，通过集成数据库鉴定蛋白质功能、所属的家族及其包含的结构域和位点
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- 每天学习一点点
- 发布于 2023-12-12 16:15
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MarkDuplicates 过程中报错：Value was put into PairInfoMap more than once
RNA-seq分析进行SNP calling之前会对bam文件进行一系列处理，包括排序、去重、将落在外显子上的reads分离出来，取出N错误碱基，在去重（MarkDup）过程中出现报错： 是由于fq文件中出现了两次...
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- Ti Amo
- 发布于 2023-12-08 14:33
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好用的perl模块推荐
Path::Tiny 是一个专注于简洁性和便利性的 Perl 模块，用于处理文件和目录操作。以下是 Path::Tiny 的一些主要功能 1，目录相关 在perl 里很多人会使用 mkdir path unless(-d path); 来创建...
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- xun
- 发布于 2023-12-07 16:16
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微生物多样性扩增子（16S/18S/ITS）课程更新v2.0
微生物多样性扩增子（16S/18S/ITS）课程更新v2.0
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- omicsgene
- 发布于 2023-12-05 13:25
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Python模块导入的 路径索引
在使用python的时候经常需要调用库及module，有的时候分明已经import了，在运行的时候却收到 ModuleNotFoundError的报错。那么Python到底是从哪里、以什么样的顺序调用的呢？ 在Python中有内建...
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- Ti Amo
- 发布于 2023-12-05 10:17
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vcf过滤时GATK和bcftools的index报错及解决方式
gatk报错 An index is required but was not found for file drivingVariantFile。 bcftools报错 index: the file is not BGZF compressed, cannot index
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- 星莓
- 发布于 2023-12-05 10:01
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