桑基图是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”。...
对e-value值的by chance 进行解释
扩增子单条序列注释 汇总代码如下 import rewith...
rMATS turbo使用
seqcluster软件安装
对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...
ComBat-seq
我们进行文件下载的时候通常可以直接通过网页的download或者是服务器的wget命令,但是是一个需要登陆的ftp地址,这两个方法就不太适用了,本文提供给大家一些ftp地址的登陆方法。 1. 个人电...
sort命令有很多选项参数,其中-n选项可以对文件内容进行数字排序。但是当想排序的列是由字符和数字组成的时候,这个选项就不能达到想要的效果。 1.例如,对某个文件列进行排序: #cat 1.txt11...
在对基因组进行评估的时候,LAI是连贯性完整性的指标之一。目前经常使用的计算 LAI 的软件是 LTR_retriever,他并非是一个单一的工具,而是通过整合多个LTR预测软件的结果,过滤其中的假阳性LTR...
compare_means()函数进行t.test时报错——“not enough 'x' observation”
perl data.pl id1.txt id2.txt 现有一文件,有两列,是按照第一列内容进行展示的,如下图:A green;red;blueB yellow;greenC red;blue;grey;pink;blankD green;grey现在想将文件...
利用 NAS 对实验室数据进行存储备份
给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram,直接附上代码: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager")}BiocManager::install("microbiomeMark...
Rocky 9.1修改IP地址
通常进行SNP calling的之前我们需要对比对的bam文件进行排序、去重等工作,在这里介绍几种sort bam的方法。 1. 按照比对位置进行排序 sambamba比samtools快很多,samtools和sambamba默认按...
结构变异结果文件格式转换工具——SURVIVOR
转换成dummy dummy-variables
很多时候简单的try函数就能够增加脚本的鲁棒性,随着脚本逐渐复杂,一些较高级的错误处理函数就必不可少了,我们今天来介绍几个R中的 1. tryCatch() 函数 功能: tryCatch() 函数是一种更复杂...