easySFS的使用

位点频谱SFS (site frequency spectrum),用来显示一个种群中特定基因座上各个等位基因所占的频率。easySFS是一种高效构建位点频谱的工具,它可用于将VCF转换为dadi/fastsimcoal/momi2可接纳的格式进行人口统计分析。

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-07-20 15:10
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vscode如何下载安装并连接服务器

https://code.visualstudio.com/ 直接去官网下载自己版本的安装器 跟随指引一步一步安装,都是中文的 注意,如果是windows,则在附加任务部分按下图勾选安装完成后打开软件,这里以mac为例,...

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  • xun
  • 发布于 2023-07-19 18:01
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vim显示行号、跳转到指定行或列

一、显示行号 命令模式输入 :set nu或:set number Tips:如果要设置每个打开的文件都默认显示行号,则使用vi编辑~/.vimrc文件或者/etc/vimrc文件,在该文件中加入一行set nu,保存并退出...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-07-19 13:50
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sort按科学计数法排序

在使用linux中的sort命令排序时,免不了有p值是科学计数法的情况 可以使用-g参数来对科学记数法的值进行排序,而且默认是从小到大排序。 以下是其他常用参数:

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  • 星莓
  • 发布于 2023-07-19 13:37
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如何设置服务器RAID

设置服务器RAID

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  • 安生水
  • 发布于 2023-07-19 09:55
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Linux中用户组的管理:添加、修改 删除

Linux中用户组的管理:添加、修改 删除

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-07-18 20:54
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百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go用法

常使用linux,但仍然需要百度网盘和外界进行沟通的用户一定知道bypy,不过遗憾的是,这个软件python写的软件太过缓慢,不过我最近发现了一个软件,BaiduPCS-Go 他用go编写,几乎像是百度网盘li...

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  • xun
  • 发布于 2023-07-14 17:13
  • 阅读 ( 1077 )

Remote Explorer for vscode

Remote Explorer 是vscode中最常用的extensions之一,然而,如果直接使用,随着时间的流逝,他会让你的家目录越来越臃肿,因为他的缓存数据.vscode-server默认存放在你的家目录, 但是该拓展内...

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  • xun
  • 发布于 2023-07-14 15:14
  • 阅读 ( 642 )

轻松下载k8s.gcr.io,gcr.io,quay.io镜像

轻松下载k8s.gcr.io,gcr.io,quay.io镜像

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-07-13 18:47
  • 阅读 ( 1409 )

绘制PCA图时,如何删除图例中图形符号下的字母?

在使用FactoMineR和factoextra包绘制PCA图时,如果图中每个样本显示样本名,那么该图的图例中,图形符号下面会有字母,如下图左;如果图中不显示样本名,那么图例符号下面就不会有字母,如下图...

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  • rzx
  • 发布于 2023-07-12 16:26
  • 阅读 ( 671 )

pip_search,pip search 的替代品

pip search 崩溃以后,各种payhon模块和软件的管理变得异常困难不过还是有一些不错的替代品的

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  • xun
  • 发布于 2023-07-10 10:00
  • 阅读 ( 564 )

DIAMOND建库报错

DIAMOND建库报错

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  • 安生水
  • 发布于 2023-07-07 16:53
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cmplot调整四周空白区域的大小

和直接绘图使用per函数调整mar不同,cmplot包里自带了mer参数以调整四周空白区域的大小 用法类似 mar <- c(2, 2, 2, 8)CMplot( snp, plot.type = "d", bin.size = opt$binsize, chr....

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  • xun
  • 发布于 2023-07-07 16:20
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github 打开的慢,或者打不开解决办法

github 打开的慢,或者打不开解决办法

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-07-05 17:58
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GATK报错| this implies a problem with the file locking support in your operating system

##### ERROR MESSAGE: Timeout of 30000 milliseconds was reached while trying to acquire a lock on file raw.vcf.tmp.idx. Since the GATK uses non-blocking lock acquisition calls that...

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  • rzx
  • 发布于 2023-07-03 10:10
  • 阅读 ( 683 )

三代组装软件Flye安装及使用

三代组装软件Flye安装及使用

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  • 星莓
  • 发布于 2023-06-30 10:41
  • 阅读 ( 1375 )

R脚本报错|URL 'https://raw.githubusercontent.com/YinLiLin/R-CMplot/master/R/CMplot.r': Timeout of 60 seconds was reached

在运行R脚本的时候,出现报错,提示CMplot这个包连接超时。 Error in file(filename, "r", encoding = encoding) :  cannot open the connection to 'https://raw.githubusercontent.com/YinLi...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-29 13:37
  • 阅读 ( 603 )

grep --color=auto使用用法介绍

grep是一个常用的文本搜索工具,用于在文件中查找文本字符串。grep--color=auto是grep的一个扩展选项,主要功能是匹配的特定字符串加上颜色以区分,并可以进行高亮显示。可以方便我们快速查找相...

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  • 安生水
  • 发布于 2023-06-26 14:49
  • 阅读 ( 1006 )

Seqtk | 一个快速处理FASTA和TASTQ文件的工具

Seqtk工具地址:https://github.com/lh3/seqtk Seqtk工具命令: 操作举例: 01. 将FASTQ格式文件转换成FASTA格式; seqtk seq -a in.fq.gz > out.fa 02. 将FASTQ(Illumina 1.3+)格式...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-26 14:20
  • 阅读 ( 1675 )

Rush:一款强大的Linux并行任务执行工具

Rush(Rapid Utilities SHell)是一款强大的并行任务执行工具,专门设计用于在Linux或Unix环境中进行批处理任务。该工具的设计初衷是为了使并行处理和任务管理变得更为简洁明了,同时具备灵活性...

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  • xun
  • 发布于 2023-06-20 14:15
  • 阅读 ( 1041 )