Mapman对表达数据进行聚类分析

Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物代谢通路注释+基因表达可视...

Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下:

从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman 

按shift 或者ctrl,进行多样品选中,再右键选择cluster ,或者在主界面选中cluster进行聚类分析后,即可进行聚类分析,之后可根据分析结果,了解每一个cluster中具体的基因情况,并根据图片了解其表达趋势。

1 途径1-选中样品,右键选中cluster data 在弹出框中选中mapping进行分析

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2、途径2 主显示窗口选中cluster experimental data... 弹出的窗口中确定样品与mapping进行聚类attachments-2018-07-i9xz04AD5b5ad444c4db7.jpg


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3、结果--获得的结果中涉及了具体的clustet数,单击对应的图片会显示具体的cluster结果,每个结果中对应具体的聚类的bin及涉及的基因和在选中的样品中的表达情况


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  • 发表于 2018-07-27 10:17
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  • 分类:软件工具

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Daitoue
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