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老师,我在进行第一张图上的操作后,查看得到的文件,但显示的并不是您第二张图上的样子,而是第三张图片,这是为什么呢?
明楼
2022-04-11 11:14
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请问edgeR差异分析报错是matrix有问题吗怎么调整呢
Fion
2022-04-10 00:51
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我按照链接文档安装,但是都失败了。我用我同学的电脑安装一次就成功了。想知道我电脑为什么安装不了的原因。
夏晚迎风
2022-04-08 21:17
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TCGA数据下载完成后,运行prepare代码进行数据整理时报错,如图所示,各位老师如何解决呢?谢谢啦!
GDCprepare
2022-04-08 13:14
1
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老师您好,我问过我们这边的一个老师,他是直接用的我的plink_pca.eigenvec文件直接在R绘制的,并且没有用我的分组信息,直接PCA就可以做出来图,他说可能是我的分组有点问题,但是我用这个分组可以完成进化树和structure绘图,做PCA的图却只有框没有点
群体结构分析
Invincible
2022-04-08 09:46
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老师,请问pheatmap做热图,要对数据取对数,在脚本里怎么加
pheatmap
十一
2022-04-07 17:37
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老师您好,我的项目是对一种昆虫的六个不同的土著种进行重测序分析,每个土著种只有一个样品,也就是说我一共只对6个样品进行分析,我目前买了咱们群体结构分析的课程,pca分析好像不太适用于我这么少的样品,想请问老师我除了群体结构分析里的内容还可以针对哪些内容进行分析呢,老师可以给我推荐一些课程
Invincible
2022-04-06 21:11
1
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老师您好,我在进行连锁不平衡分析时,在这一步遇到了问题,这是什么原因呀,我的分组是这样的,是不是因为我的每个分组里只有一个样品才不行呀
群体结构分析
Invincible
2022-04-06 21:01
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WGCNA TOM可视化报错
TOM
2022-04-06 13:13
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老师,您好,昨天我跟着您的视频在docker上做blast分析,但我不知道怎么从第一个界面退回第二个界面,请问是需要按哪个按键?
明楼
2022-04-06 08:43
1
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在进行docker中blast分析时,请问有谁知道怎么从第一个界面退回第二个界面。
2022-04-05 22:22
1
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老师您好,我在用iqtree绘图和pca绘图这里都遇到了行列数量不同的情况,但是我的分组是这样的,这个要怎么解决呀
群体遗传进化
Invincible
2022-04-05 21:31
1
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老师,我在共线性分析作图时出现了问题,您能帮我看一下吗
McScan
沙思琪
2022-04-05 11:45
1
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老师,我在共线性分析时/biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX mcscan/AT出现错误,您能帮我看看是什么情况嘛?
mcsan
沙思琪
2022-04-05 10:55
1
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老师您好,我在fasttree构建系统发育树这一步,程序会被kill掉,看不到报错,前面的程序运行的都没有问题,唯一的一处报错出现在给vcf文件排序这里,但是这一步生成文件了 而且下一步转换格式也没有问题,这个该怎么解决呀
群体结构分析
Invincible
2022-04-04 16:09
1
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sam 转换成bam 格式并排序时,没转换成功。reads 与基因组进行比对map这里出错。
samtools
hisat2
星野
2022-04-03 16:51
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老师您好,之前服务器系统重新装了一次,然后安装了最新版本的megacc,现在跑序列较多的进化树就会出现这样的报错信息,我想请教一下原因
2022-04-03 09:21
1
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老师您好,群体结构分析自己的数据时,进行到文件格式转换那一步遇到了问题,报错写的是要将vcf文件正常排序,我自己在网上找到了相应的脚本,却不能正常运行,报错写的是不能生成JAVA虚拟机,我的脚本是不是有什么问题呀,这个应该怎么解决呀
群体结构分析
Invincible
2022-04-02 21:18
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大家好!我想问下Fst&pi进行选择性消除分析后,得到的fst-pi.A-vs-B.selected.region.txt文件里的信息是A群体受选择的窗口还是A和B总的受选择的窗口?我怎么可以得到A或者B群体受选择的窗口啊
2022-04-01 21:18
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我想问下基于Fst$pi进行选择性消除分析时,所关注的群体的右边受选择地区域如何找到呀?我看生成文件中是fst-pi.merged.all.txt,这个文件里地窗口内容应该是左右两边受选择的总的窗口
2022-04-01 19:52
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