Plink可以计算IBD吗?

Plink计算IBD的方法是什么?具体怎么操作呀?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以计算IBS:

#plink 方法 :plink IBS 方法检测离群样本:https://zzz.bwh.harvard.edu/plink/strat.shtml#outlier
 plink --vcf all.clean.vcf.gz    --cluster --neighbour 1 5 --allow-extra-chr -out outlier_ibs --mds-plot 4

IBD计算不清楚
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