3 在进行全基因评估后,出图不正确,同时在进行hifiasm三代组装的时候总是出现问题

attachments-2024-04-z2g08JuZ661c9f7f80825.pngattachments-2024-04-wqprbmJJ661c9fd678e36.png图1是基因组评估问题,图2是进行hifiasm三代组装出现的问题,, k的取值对评估结果影响大吗,比如k取17或者19

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的genomescope 评估基因组,图很奇怪,可能是测序的数据量不够导致,一般建议基因组测序50X以上评估;数据量太少评估不准确,你看看你的数据量相对基因组是否足够;


组装抱错,这个就抱错信息可能是时间久服务器断开了,组装时间比较久,建议你把任务转后台运行吧;


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