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bio-linux中用hmmsearch遇到问题

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小麦基因组Un不能做串联重复的话，做大片段重复和共线性分析可以吗？还是Un序列上的基因只能以同源基因来说明，谢谢老师

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请问老师我做了一个植物 基因原核表达到载体里验证功能 验证这个植物基因TPS家族的一些基因。

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10 基因ID、cds ID与蛋白ID三者均不一致

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请问老师，在用tbtools做进化树，基因结构，motif三者图时，出现进化树基因有43个，但是基因结构图和motif图基因数只有36个是撒原因？？

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TCGAbiolinks包

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conda update CondaHTTPError: HTTP None

  • 2020-03-13 15:21
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5 基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件

1 解决

老师您好，咨询一下转录组和基因家族结合发文的问题

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老师您看，我通过ascp告诉下载下来的SRR 文件，他的压缩格式是.gz? 较普通的gz压缩文件多了一个问号，而且无法解压，也无法改名和移动路径，望老师解惑，这是怎么一种情况呢，谢谢老师!

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老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错，请问您知道大概有什么原因吗？

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做物种间共线性分析报错，请问哪位大神可以指点一下

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共线性分析

  • Li 2020-03-11 20:17
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老师，我这儿在Linux系统上安装了一个aspera的软件，然后我设置添加环境变量一直不成功呢，一直出现下图这种情形呢，老师您看如何解决呢？

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10 求助大佬，circos图chr.info文件怎么整理？

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5 老师您好，我下载了Vm在管理-导入导入虚拟电脑时报错， 错误码：返回 代码: E_INVALIDARG (0x80070057)

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使基因ID与parent的ID一致，用sed命令处理完之后发现ID下划线后面与其他ID不一致，是不是需要手动删除？

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设置共享文件夹失败 提示no such device

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5 老师您好，我在用MEGA构建完系统进化树后，树的下方有一大片空白，选中某一分支的绿色选中框也偏下，不在分支本身，卸载了又重装，重新分析建树依旧是这种情况，想请教一下老师有没有遇到过这种情况，谢谢！

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老师您好，如果我的试验设计是在损伤胁迫后0h，4h，8h，12h，24h的转录组测序，每个时间点三个重复。那么这样的一个试验，在做WGCAN分析的时候形状数据文件该如何整理呢？一个时间点就是一个性状吗？还是这种试验设计没有性状数据？