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基因家族结构域及基因家族长度问题

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请问在进化树+基因结构+motif+domain的四联图中，为什么domain结构在tbtools上显示不出来？？以下是我设置的domain文件，请看看有何不妥？谢谢

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5 请问MEME软件如何确定motif个数？？应该设置几个呢？查文献查不到，没有这个物种

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请问编码区序列长度怎么计算呢（cds/bp）

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5 基于转录组做了基因家族分析，结果基因组出来了，数据未公布，这个还可以再用吗？

  • 2021-01-19 02:25
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老师您好。做GSEA分析图，我在上传文件 的时候。文件名是.gct。出现下图所示这样的错误，请问是什么原因呢?怎么处理？

  • 2021-01-18 11:49
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10 老师 ，您好，我想请问一下qiime2双端拆分barcode的事情，如果您回复，将感激不尽

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docker desk中设置文件共享夹不能同步

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老师你好，我在紫花苜蓿的全基因组数据库中通过Blast比对得到76个WOX家族基因，这76个基因的序列都是不同的，但有的很相似，可能是同源基因，用不用去冗余

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TCGA的甲基化差异分析只分析配对样本，还是比较所有正常样本和肿瘤样本？

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SRA数据下载

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老师好，我的structure分析输出为空的，下面是我的基因组gff文件基因的id名字后面还有外显子内含子等等 get_gene_exon_from_gff.pl

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提取蛋白序列报错

  • 荣 2021-01-13 21:26
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10 老师，您好，我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的三个方法中，都出现了运算中断的问题，不知道哪里出错了，在挨个进算的时候发现图中的这步运行有问题，老师您看看是哪里出错了(╥_╥)

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关于VirtualBox中biolinux挂载共享文件夹的问题

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在基因家族分析过程中，确定结构域的时候发现一个算是该基因超家族但不是该基因家族的成员，那这个算是该基因家族的成员吗

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老师好，想问下将蛋白质序列提交的MEME在线软件后，几天后为什么没有结果啊?显示工作已完成，却没有结果，谢谢

  • ljx 2021-01-11 12:46
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5 基因家族分析

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您好，老师，我这段代码想实现个循环，可只输入fd文件的第一个数据，就输出了，实现不了循环，麻烦老师给指导一下，谢谢老师

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老师，您好，我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的第一个方法中操作 pick_de_novo_otus.py 这一步，缺少了很多文件，之后我又单独操作的，在操作第三步 # Assign taxonomy command 时，没有出现qiime_rep_set_tax_assignments.txt 这个文件，第四步也没有办法操作，是哪里出问题了呢