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同一物种不同基因组(已经组装好)之间可以call snp么
snp-index
ed算法
BSA;QTL-seq
EMS
没有好名字略略略
2020-11-12 01:20
1
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4011
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5
如何从CAFE结果中提取扩张(或收缩)的基因家族
cafe
cafe
teamkhuang
2020-11-09 16:56
1
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5
hmmsearch新建HMM模型之后再次搜索出现报错,请问老师什么原因
麦田里的稻草人
2020-11-07 10:13
1
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RNAseq转录组-基因差异表达分析
转录组
R语言
Bella
2020-11-05 22:31
2
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5
各位老师好,我买了你家的基因家族的课程,我咨询一下几个问题:(1)我分析NBS-LRR基因家族,其中CC结构域没有hmm文件,你们分享的文献中说用Paircoin2软件,我想问一下,这个软件怎么使用;(2)我用figtree美化进化树,为什么树枝上的Bootstrp是小数,而不是MEGA建树中的整数。
小强
2020-11-05 15:33
1
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3
共线性分析做组间时,anchors文件只有以下内容,进行后续筛选和绘图时,报错为“need more values to unpack",请问是何种状况?mcscanx分析有物种和同源性要求吗?
基因家族
学而时嘻嘻
2020-11-04 21:17
1
回答
3866
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5
进化树构建出问题
进化树构建
tree
2020-11-03 00:54
1
解决
2059
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5
请问老师基因家族分析这一步出现错误怎么解决,谢谢
麦田里的稻草人
2020-11-02 22:50
1
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2586
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5
不好啥意思打扰了,我在服务器上用ClustalW对2000个基因进行比对,想看一下基因多态性,但是比对了很久,显示第5次跑数据了,是出了什么问题吗?比对完成后如何把非此基因的冗余序列去除,并进行可视化呢
序列同源性
NK-F
2020-11-02 10:58
1
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3890
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20
gdcRNADownload(project.id = 'TCGA-CHOL', + data.type = 'RNAseq', + write.manifest = FALSE, + method = 'gdc-client', + directory = rnadir)
TCGA
TCGAbiolinks
逐影
2020-10-30 20:40
1
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3759
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5
亚细胞定位怎么看啊
浪失杂货铺
2020-10-29 16:46
1
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2799
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5
请问我的circose作图没有灰色部分?确认是按视频说的做的,哪里出了问题呢?
MCScanX
学而时嘻嘻
2020-10-28 19:58
1
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3118
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5
基因id与cds id不一致,无法提取cds序列怎么办
基因组学
学而时嘻嘻
2020-10-28 19:33
0
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10
老师,有没有什么能够做基因置换相关工作的软件
2020-10-28 00:07
1
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2246
浏览
10
在运行VirusDetect_v1.7时报错
所得皆惊喜
2020-10-27 12:44
1
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5400
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20
用iTOL美化进化树时出现如下问题,求解答。
dec.
2020-10-27 11:57
1
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5
MCScan(jcvi) 生成anchors文件大小为怎么办???
基因家族
学而时嘻嘻
2020-10-26 23:32
1
回答
3418
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10
使用get_gene_length_from_gtf.py脚本统计基因长度时报错
GTF
章鱼哥吹笛子
2020-10-26 17:00
0
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2530
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5
关于用SVM和LASSO方法筛选标记基因的问题
imdj28
2020-10-21 23:33
0
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如何用PAML通过4d sites计算mutation rate?
高伟
2020-10-18 17:12
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