5 安捷伦双色通道:探针表达值是什么?log2(R/G)还是 log2(G/R)

R是红色的处理组的荧光,G是绿色的对照组的荧光。这里的“对照组”是指健康人的标本吗?R/G的意义是什么,log2(R/G)就是探针表达量吗?下图有两个channel 因此是双色通道,经过log2转换过。然而下面出现了log2(G/R),完全使数据的正负性发生了改变,进而影响了我对logFC的判断,不知道该探针到底是上调还是下调了。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

处理样本一般标红色荧光cy5 (R) ,对照样本标绿色荧光cy3 (G),

两个比值 你自己看想用哪个用那个,这些样本信息文字要看看:


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log2(R/G)  这个比值就是差异比较结果

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  • 提出于 2021-01-26 13:49

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