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Tassel进行自己的GWAS分析中，自动分析pca时，不生成pca1~3文件（使用的是服务器）

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如何清除后台的这个镜像呢

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单细胞测序数据FindAllMaker查找不同Cluster的Marker基因

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5 进行基因注释过程中运行这个脚本perl $scriptsdir/pasa_extract_best_candidate_geneModels.pl $DATABASE.assemblies.fasta.transdecoder.genome.gff3 $DATABASE.assemblies.fasta.transdecoder.cds 3 900 0.60 0.95 0.95 > best_candidates.gff3出现错误。希望老师解答，谢谢

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VCF文件

  • bomm 2024-01-25 00:00
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cytoscape替换ID报错

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请问老师怎么获得这个gff3_file_to_proteins.pl脚本来着？

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输出的关联区域内基因的文件是空的，难道是因为region_merged.bed内的内容太少了吗

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使用了pop-evol-gwas2.0,还是报错，但是我安装的时候这个2.0特别快，一下就好了。

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老师请问这个比较基因组课程里串联法构建进化树，脚本里面的构树次数是不是不能小于50次啊，然后想问一下串联法和并联法一般来说哪个方法出结果比较快。

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3 怎么把GB文件转为GFF3文件

1 解决

为什么做gwas分析的时候，经过性状数据分析的步骤后，输出的文件种表型只剩317个，都是我的数据应该是340个左右（只是一年的数据）

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GeMoMa报错

  • suj 2024-01-22 10:56
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变异结果过滤，gatk VariantFiltration

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老师我在做比较基因组物种进化树构建的时候出现这种报错请问是什么原因，是电脑性能不够吗

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mega上拖进fasts格式文件时显示文件解析错误

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5 老师您好，我做顺式元件分析结果做出来的图无论是TBtools还是课程中的GSDS绘图最后出来的结构都是太长了，这个结果正常吗？我看别人文献的结果就一个点，这是为什么呢？

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获得初步基因家族基因列表出错

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用Docker进行单细胞测序数据合并时，执行合并代码时候，报错。

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老师我做比较基因组的时候，准备文件阶段时用Ensembl 下载的基因组为什么跑不出来cds和蛋白质文件，跑出来的结果都是0kb，wsl内存也设置了，麻烦老师您再看一下