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重测序

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重测序

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老师，在泛基因家族分析，我提取最长转录本时输出的gff文件是空的，能帮我看一下为什么吗

  • aa1 2025-01-06 09:35
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老师就是做到xpclr和TajimaD的时候 出现下面的错误 要怎么解决呀

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老师 就是在做种群动态历史那里 我截频红色箭头指出的那个bam文件，是把所有的bam文件合并在一起的吗 还是什么意思呀。

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老师 我在做主成分分析的时候 出现下面这个错误 需要怎么解决呀，下面那张图是分组情况

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老师 就是 您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传过滤的条件有一点不一样 那个才是对的或者两个都对 我截屏放一次下面啦 您看一下

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老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件，这个是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一个过滤参数嘛 谢谢我重测序的个体才36个

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老师，就是我在做结构变异分析那里，我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀，谢谢老师

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老师，就是我在做结构变异分析那里，我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀，谢谢老师

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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢

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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢

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遗传图谱分析课程

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二代和三代sv数据合并出现问题，若能回答，万分感谢

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群体sv分析

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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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您好，想请教一下 linux中 R语言安装magick的包装不上的问题

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hmmsearch 关于参数--cut_tc设置

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binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

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binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢