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比较基因组学NCBI数据提取CDS失败

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10 做真菌有参转录组测序，mapping值很低。

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10 老师您好，我想请问我的种源地不知道，做完群体遗传，从进化上看看群体材料的差别，然后能做候选基因的功能分析吗？，我想把全基因组重测序和代谢组关联起来，然后找到候选基因功能验证，请问这个可以吗？谢谢老师的解答

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iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G -m MFP+ASC -redo -B 1000 -bnni --prefix iqtree 出现报错

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NCBI上下载的CDS序列的ID和GFF文件的ID对不上，导致CDS提取失败怎么办

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比较基因组，无法获得pep和cds序列

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iqtree 分析需要ASC矫正嘛？

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gatk callSNP 和bcftools call snp 哪个会更好一些，bcftools得到的 all raw vcf.gz ,也是使用4.snp_indel的过滤1/2/3 步骤进行过滤嘛？ 过滤1：gatk VariantFiltration过滤2：vcfutils.pl过滤3：vcftools。

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run_pipeline.pl -Xmx30G -importGuess all.clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter 做iqtree分析的时候，转换文件格式报错

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基因芯片探针与基因ID转化

  • ZLX 2023-07-29 16:31
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5 基因家族MCScanX共线性分析中是否把串联复制和大片段复制都筛出来了？

  • 2023-07-29 15:06
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各位老师好，我在使用geneid_to_mRNAid脚本提取自己基因组gff文件时报错了,但提取其他的是正常的,请问是怎么回事?

  • 2023-07-28 01:44
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LTR_retriever结果问题

  • 2023-07-27 23:13
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利用代码绘制共表达网络时，有一个聚类最多的基因颜色模块没有导入Cytoscape的两个文件，谢谢老师

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如何通过GWAS的曼哈顿图结果筛选基因？

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您好，关于随机森林那篇博文中的数据能够分享吗？

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老师您好，我想请问我的种源地不知道，要做群体遗传是不是先做个分子标记，鉴定一下亲缘关系，然后把亲缘关系近的剔除就可以做群体遗传了

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单克隆抗体和多克隆抗体的区别?单克隆抗体的制备过程是怎样的？

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请问种源地不清晰能够做群体遗传吗

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基因家族分析的蛋白结构预测，怎么比较预测的不同亚类蛋白3D结构的相似性？