2 解决

5 bioLINUX 共享文件夹 command not found

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使用mega7 根据hmmsearch结果得到的confirmed domain构建进化树，出现如下错误，请问如何解决？

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一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的，这个文件中我看值应该是去过log2的，我看网站介绍说文件里面的值是Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1，这句话是不是意思是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据，如果是的话我可以直接看出基因的差异表达了，我可以直接拿这个数据来作图说明我所研究的基因家族成员发生了差异表达吗？因为在文献中也没有见过这种情况的作图，希望老师指点一下，谢谢老师

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5 您好，我再用ftp上传数据到NCBI上出现了和您一样的问题，请问您解决了没有呢？

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5 如何用荧光定量验证转录组结果

2 解决

5 您好，我想问下如果我的基因家族有两个结构域，两个pfam号，我应该怎么筛选呢？？

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5 你好，我在MCScanX共线性分析过程中用get_gene_position.pl提取基因位置信息的过程中，提取的信息不太对

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图一与图二的格式不同是否会影响使用？如果影响，如何用bio-linux系统修改序列由图一变成图二？

  • CC 2019-07-06 23:59
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5 老师，您好！打扰您了。我想问一下这个问题如何解决：我第一次用GSDS网页修改好第一个基因结构图后，再修改第二个时，点击编辑后，出现的页面却是第一个基因（已经标记好的），请问如何消除记录呢

  • 2019-07-06 22:34
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请问一下这些处理的缩写都是什么意思？

  • 2019-07-06 22:31
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老师，我想问一下课程里面有个课程是可以处理双通道芯片的，它是具体处理出来是怎么样的呢，是知道了每个处理的表达量吗

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老师请问一下这种图是怎么做出来的呢？我会做内含子外显子的图，也知道图上所得到的ghr-miR的信息，可是我无法把这二者像此图一样结合到一起

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想绘图应该学R语言还是perl语言呢

  • 2019-07-05 15:02
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为什么随着read延长，测序错误率呈现升高趋势？read2错误率要普遍高于read1错误率？

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为什么read1和read2前几个碱基的错误率较高？

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老师您好，我想问一下在GEO中的双通道芯片里面可以下载到的series_matrix.txt文件中的数值是有正负求的，并且数值基本没有超过10的，是不是说明这些值已经是处理和对照的比值然后取了log2所得到的呢，如果是的话我是不是可以直接通过观察这个文件里面的值就可以看到我所研究的基因有没有发生上调和下调，然后可以直接用这个值来做我的基因家族成员表达的热图吗

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5 GEO双通道芯片数据

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5 smart批量分析结构域

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5 转录组数据分析，差异基因的功能在GO和其他数据库（NR, Swiss_port, Pfam）上有注释，但是KEGG上却没有，这是什么原因造成的，分析的时候应该以哪个为准，求前辈们指点

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用TCGAbiolinks下载数据时无法选择primary site的分类