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基因家族分析

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老师，python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性时查文献没有对照物种别人鉴定的基因，要自己先去鉴定吗

  • 2022-03-14 16:05
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老师你好，mapchart添加标尺的时候总是出现下面的情况，标尺附近有黑条纹，另外我要怎么调整标尺的刻度大小

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如何挑选所需的顺式作用元件？

  • Mask 2022-03-10 21:40
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只有基因组草图没有染色体级别的基因组可以做基因家族分析吗？？？？

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基因家族分析课程出现hummer程序过期情况

  • Mask 2022-02-28 22:59
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老师好，我用hmm搜索斑马鱼TRP家族基因时发现搜索结果为空，但是斑马鱼是含有该家族基因的，请问这是怎么回事？

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使用MEGA构树时说是我的序列无效怎么办呀

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在做circos图时，报错提示我要将max_ideogram修改一下，请问要如何修改呢？

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进化树

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请问老师，motif分析之后，html文件打不开，显示如下

  • hoo 2022-02-21 18:46
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3 共线性分析报错

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老师，请问下两次hmmsearch的结果一样正常吗?

  • 2022-02-15 12:56
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10 基因家族分析--定量问题

  • 2022-02-11 22:30
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10 基因家族分析

  • 2022-02-08 23:17
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在制作基因结构图过程中gene_exon_info.gff文件为空 打开gff文件发现如下情况，请问老师应该如何处理呢

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5 老师，使用非ensemble数据库的蛋白质序列和基因组染色体fasta文件脚本要怎么进行修改呢？

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ensemble下载的gff3和toplevel文件无法解压

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老师，我用hmmsearch 没搜索出结果，然后用拟南芥的query.fa和我要分析的物种cds进行blast分析，比对出来的基因只有几个，我老师说我要做的基因有200多个，完全对不上，不知道该怎么办了，请教下老师。

  • 2022-01-25 20:55
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老师您好，我在做不同物种之间共线性分析的时候，在#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件出现如下错误：IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'mcscan_layout'

  • 2022-01-24 02:26