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circos作图上染色体颜色的设置

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老师您好，我做藻的基因家族分析，构建进化树的过程中遇到了mega软件比对NJ法不能够完全比对成功，显示总是有一次错误，进化树显示不完全，更换其他方法后，进化树也都显示不完全，请问这样的有什么解决办法嘛

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MEME分析中，motif的E-value值太高，意味着不准确了。对吧。

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老师，在进行基因上游顺势原件分析的时候，得到的图是下面这个样子，怎么办啊？

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老师，我在进行基因上游顺势作用原件分析的时候，在得到feature文件的时候是根据第一张图片的命令改的，改的命令在第二张图，但是我没有得到feature文件，这是为什么啊？

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老师您好，基因家族分析时，用拟南芥某基因家族用blast比对目标物种蛋白质序列，最后得到的结果有503条，这503条应该怎样取舍，然后做下一步结构域搜寻？谢谢

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老师，我做进化树+基因结构+motif一张图全显示的时候是这个样子，为什么有很多基因没有基因结构？但是我在GSDS上得到的基因结构图是长这个样子的，这是为什么啊？

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老师，我在进行基因结构展示时，GSDS error报错，是下面这个图片的样子，这是为什么呢？是哪一步出错了？

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老师，我基因组间共线性报错，能帮我看一下吗？ls之后有mcscan_layout

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通过blast比对来确定基因家族

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老师，输入这个代码echo "1\nT-box_domain.fa\n2\n1\ndomain.aln\ndomain.dnd\nX\n\n\nX\n" |clustalw之后，会循环下面的页面，无法输入选择和输入文件

  • 2022-04-21 15:41
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3 使用evolview美化进化树时，执行部分填充命令，却会填充所有线条颜色

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virtual box共享文件失败

  • Zik- 2022-04-18 12:51
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老师您好，多序列比对完后构建进化树遇到了错误，建不了树，但是删掉几个序列较短的基因又能建树，这种情况怎么办，如果在筛出一些基因要怎么筛除

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您好，我想问一下关于《基因家族鉴定分析操作手册》当中2.3blast的问题

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基于转录组的基因家族分析

  • 2022-04-12 20:54
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5 用hummer 的脚本（domain_xulie.pl）运行出来的保守结构域是空的，之前hummer search都很正常

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基因家族用MEME工具预测motif时，序列有1500多个，结果中只显示了挖掘到的motif，却显示不了在每个基因上的位点图，怎么办？

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老师您好，我在建立共享文件夹的时候出错了，具体问题我上传了图片，麻烦老师帮我解答一下，感谢老师

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老师，我在进行第一张图上的操作后，查看得到的文件，但显示的并不是您第二张图上的样子，而是第三张图片，这是为什么呢？