发现
问答
发起
提问
文章
文章
更多
专家
讲堂
话题
财富榜
商城
Toggle navigation
首页
(current)
问答
文章
视频课程
话题
商城
搜索
登录
注册
全部
转录组
宏基因组
其他
重测序
文献解读
软件工具
python
perl
R
linux
lncRNA
smallRNA
甲基化
GWAS
TCGA
蛋白质组学
基因组学
实验相关
测序技术
代谢组学
基因家族分析
视频课程
WGCNA
基础知识
临床医学
科研作图
三代测序
遗传图
GEO
遗传进化
最新的
热门的
悬赏的
未回答的
2
回答
1825
浏览
老师好,我的structure分析输出为空的,下面是我的基因组gff文件基因的id名字后面还有外显子内含子等等 get_gene_exon_from_gff.pl
STRUCTURE
阿健
2021-01-14 00:03
2
回答
1779
浏览
提取蛋白序列报错
提取序列
荣
2021-01-13 21:26
1
回答
1717
浏览
在基因家族分析过程中,确定结构域的时候发现一个算是该基因超家族但不是该基因家族的成员,那这个算是该基因家族的成员吗
杨辉
2021-01-12 10:16
1
回答
2296
浏览
老师好,想问下将蛋白质序列提交的MEME在线软件后,几天后为什么没有结果啊?显示工作已完成,却没有结果,谢谢
meme
ljx
2021-01-11 12:46
1
回答
1752
浏览
5
基因家族分析
Chenjiamin
2021-01-11 11:22
1
回答
1202
浏览
比较基因组学分析时报错,无法生成 anchors文件
anchors文件
吃不饱的魔王
2021-01-10 17:18
1
回答
2038
浏览
脚本参数--minsize=0 --minspan=30
徐渴
2021-01-09 16:26
1
回答
1048
浏览
5
老师您好,文件共享挂载出现错误应该怎么解决呢?
塞上胡笳音
2021-01-02 14:22
1
回答
2413
浏览
基因家族分析,用CDD确认结构域的时候,根据统计的表格,怎么找到那些未匹配到相应结构域的基因或者序列是哪个?
CDD
杨辉
2021-01-01 00:22
0
回答
2608
浏览
在基因家族分析的时候,结构域的筛选E-value值的时候,选取小于0.0001,运行命令,结果中并没有排除掉一些大于该值的序列,3.4e-05到底等于多少,是3.4乘以e的-5次方还是3.4e的10的-5次方
杨辉
2020-12-30 19:59
1
回答
1372
浏览
利用Linux制作circos配置文件时,result文件无数据
circos图配置文件
吃不饱的魔王
2020-12-30 16:36
1
回答
1687
浏览
请教老师,用自己的hmm文件,进行了domain的二次搜索,结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后,再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是,如果要这些部分的结果截取序列,做进化树就会差异太大。如果不要部分比对上的,又怕少了家族序列。只有一部对比上的,到底如何取舍呢?这样的情况如何处理,有没有相关的标准?谢谢
比对结果筛选
萝卜少少
2020-12-30 10:01
1
回答
2695
浏览
基因组间共线性分析
python版mcscan
秋风
2020-12-30 08:52
1
回答
1456
浏览
请教老师,用自己的hmm文件,进行了domain的二次搜索,结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后,再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是,如果要这些部分的结果截取序列,做进化树就会差异太大。如果不要部分比对上的,又怕少了家族序列。这样的情况如何处理,有没有相关的标准?谢谢
萝卜少少
2020-12-30 00:10
1
回答
2543
浏览
植物的MADS-box基因家族
苦行僧
2020-12-29 16:36
1
回答
2391
浏览
老师,我在重新描述一下问题,mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对,数目不一样,是不同算法的不同结果是吗?做CIRCOS圈图时, 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗?我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。
KaKs
徐渴
2020-12-29 09:57
1
回答
3099
浏览
MCSCANX和KAKS计算出的共线性对数目不一致,虽然用的都是70%同源性。这合理吗?如果用KAKS计算出的基因对做circos圈图合理吗?
KaKs
MCScanX
徐渴
2020-12-28 13:13
2
回答
1655
浏览
老师好,想请教一下,如果拟搜索的家族是一个超家族,序列长度较长,比如图,463bp。用hmmsearch后,hit到的结果里面的hmm coord from to 是存在好多的一部分的片段,比如310~460的部分片段,但是E值很小。请问这种hit结果如何筛选?如何建立自己的隐马科夫模型?谢谢
搜索结果的筛选
萝卜少少
2020-12-28 10:02
1
回答
1668
浏览
计算串联重复时,满足两个大于75的标准,但是不在一条染色体上,也不属于片段重复(MCscanx结果显示)。请问这种情况属于什么重复方式?
tandem
omicsgene
2020-12-27 08:13
1
回答
2432
浏览
5
物种内共线性对数太少调节哪个数值可以多一些?
共线性分析
蔚。
2020-12-25 11:06
‹
1
2
...
22
23
24
25
26
27
28
...
65
66
›
今天,你的网站遇到什么问题呢?
立即提问
热议话题
»
视频课程
正则表达式
flexbar去接头
基因组圈图
内生真菌
提取上游1500bp
cd-hit
1000G
linux命令
隐马可夫文件
位置
UTR
基因组测序
标准化数据
一名小白
MEGA-X
蛋白序列的提取
线粒体
无参物种基因家族分析
基因组数据库编码蛋白
TF
CMplot
操作指令
结构域搜索
顺势作用
活跃用户
»
omicsgene
72870 经验
Daitoue
10420 经验
生信老顽童
17560 经验
安生水
18640 经验
红橙子
6510 经验
omics007
3240 经验
鹅子
70 经验
小不点
700 经验
×
发送私信
发给:
内容: