1 回答

老师，在做蛋白预测的时候总是显示desired structure doesnot exist.

2 回答

基因家族数据准备#提取cds序列#提取pep序列

0 回答

5 Orthofinder报错出现ZeroDivisionError: float division by zero

0 回答

STRING数据库映射出来的拟南芥基因号不是AT开头的

2 解决

泛基因家族分析

1 回答

组装后的cds.count文件里有小数是合理的吗

1 回答

泛基因家族分析

1 回答

老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

1 回答

老师，您好！请问做全基因组选择（GS选择）之前，训练集和预测集的划分，有没有代码可以按照特定比例，随机快速实现材料的划分，并生成文件？（比如20%个体作为训练集，80%个体作为预测集；40%个体作为训练集，60%个体作为预测集；60%个体作为训练集，40%个体作为预测集；80%个体作为训练集，20%个体作为预测集，等等）

  • 2025-08-08 16:14
2 回答

GATK CALL 变异后导入GenomicsDBImport 出现问题

1 解决

T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

1 回答

eggnog_file_process.r好像就是将同一功能下不同基因直接相加

1 回答

老师您好，在做比较基因组提取CDS、蛋白序列和最长转录本时候，提取出的文件是空的，这是什么原因，请老师解惑

0 回答

老师好，我在做gwas分析小麦时，按照脚本进行vcftools 过滤生成clean.vcf.gz 文件后出现以下问题，该如何解决

  • Max 2025-07-17 10:14
1 回答

使用eggnog对组装后的基因进行CAZy和EC酶的注释，一个序列会注释到多个正常吗？另外我还想问一下进行lda分析时，未注释到的功能或者基因应该删除吗

2 回答

老师您好，我在运行OrthoFinder2时，出现下面报错，请老师解答

2 回答

HISAT2比对时报错|sam文件为空白，summary文件为(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

1 回答

基因家族分析

1 回答

ALLHIC1挂载出现问题

1 回答

kneaddata里的trimmomatic的接头文件是通用的吗