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tree_tax出错

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老师我这里练习之前上课的内容想复制粘贴整个目录，以及创建新的文件夹都显示这个请问应该怎么办呢

  • Nier 2025-09-30 11:07
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Fst,pi, and ROD 分析

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请问我在做性状绘图时出现报错，我的数据格式应如何修改

  • Max 2025-09-15 11:23
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泛基因家族SV分析-VCF文件

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kneaddata做质控的时候，服务器卡死了，用trimmomatic+bowtie2分开跑是可以的吧

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我的关注的头足类和其他贝类的进化关系，涉及5个头足类物种4个其他贝类，基因集这里基本上都包括这五个头足类物种了，是说明头足类物种进化出或者在这些富集基因多的通路上和其他贝类不同了吗？

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PCA

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选择清除Fst和Pi联合作图

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存在缺失分析

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转录组比对中，同源性很高的两个基因比对不正确

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客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件，但是两者之间有差异，像是缺了几列是怎么回事，如下面详述，请解答

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PSMC分析

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老师docker压缩包能不能发一下，给我的文件里面没有

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泛基因家族分析

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老师想问一下，为什么我在myt2t文件下面创建，但是最后跑去了家目录下面呢，试了好几次了，而且我echo $workdir了确实也是指向的是myt2t这个文件

  • Nier 2025-09-15 12:06
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老师，就是我在用misa鉴定ssr的时候，把文件输进去出现下面这个问题怎么解决，用你们提供的数据也是一样的问题，我找不到原因

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老师，您好！全基因组选择，利用自己的SNP数据（芯片SNP）进行基因型数据处理，beagle.27Feb25.75f.jar处理完成后，得到的imputed_snp里面没有SNP标记信息。

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基因组过大，能不能分割基因组做重复序列注释

  • 2025-09-10 13:29
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老师，在初步查看cluster分群信息时，能否使用--cols代码，实现对某个cluster的颜色进行改变，具体代码是什么