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做基因家族，需要下载图片中哪些文件？Genome Gff CDS Protein dou都需要下载吗

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老师 就是我在做基因流哪里的时候 出现啦下面的问题 需要怎么解决呀

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老师，在putty中如何操作；既可以做自己的数据，又不用删掉示例数据呢？我现在想上传自己的数据；是不是得把之前的demo和data都删掉；我怕内存不够；还是说内存足够，上传的时候传成data2呢

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IBD 计算2

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老师，就是我在做结构变异分析那里，我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀，谢谢老师

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在基因家族分析中的顺势作用元件分析中有几个差不多的元件是不是一个元件

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老师您好，我手上有一个基因的基因序列，通过pfam知道了它属于哪个基因家族，但是没有找到有做过这个基因家族的生信基因家族分析鉴定的文章，请问这种情况下能做基因家族分析吗？该怎么进行呢？

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老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件，这个是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一个过滤参数嘛 谢谢我重测序的个体才36个

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gff3_file_to_proteins.pl 报错

  • Dg 2025-01-14 22:00
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如何确保.fa和gff3文件的染色体编号一致？手动修改吗；以下是两个基因组的gff和fa

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老师，这个done之后不动了，开始运行了吗？如何判断呢？

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比较基因组构建进化树，通过seqkit进行序列合并时内存爆满导致kill

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20 文献分析，只有BigWig文件能否完整做出下面的图像

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5 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

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CAZy注释阶段，hmmer的太慢占用cpu只有一直很少

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IBD计算

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您好，想和您咨询一下，我用土壤样本测微生物宏基因组注释，40个样本，一共500g左右，想和您咨询一下，一定要用服务器吗，普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗，感谢感谢

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LD绘图

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修改样本名称

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泛基因家族分析时，泛基因集构建与家族成员分析用的镜像不同，有区别吗