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老师，我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令；视频中data数据中为gff的后缀，我的数据是gff3的，把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗？

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从结构变异注释文件中提取WRKY基因结构变异信息

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在筛选GWAS关联区域内的基因时（LDBlock），基因或者SNP与选定的显著关联区域有百分之多少的交集可以定义为关联区域内的基因或者SNP？视频中说是10%，视频说的10%请问通用吗？这个10%是如何计算的？

  • John 2025-03-12 15:32
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想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

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泛基因家族，典型基因和非典型基因的热图怎么做？

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泛基因，运行代码时出现错误

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执行ALLHiC分组不成功

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如何合并两个单细胞测序中的两个子集？

  • Zzz 2025-04-26 22:41
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宏基因组基因定量salmon

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基因家族分析，最长转录本，复制的命令，还是报错。咋整

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老师您好，我在运行alpha diversity calculation 这段代码时出现报错信息，没有alpha_diversity.py这个文件，校验了下提供的代码确实没有，售后老师说可能是软件自带的，请问这种情况改如何解决？alpha_diversity.py，beta_diversity_through_plots.py，make_2d_plots.py，nmds.py，upgma_cluster.py这些都没有

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测序文件中提取基因序列

  • bomm 2025-03-09 22:57
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windows10安装docker后，输入命令，报错，请问如何解决？

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利用GATK 分染色体call 变异时出现错误

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使用monocle3进行轨迹分析报错

  • Zzz 2025-04-27 16:56
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老师，结构变异与基因表达分析中，运行这条指令（删除一些不需要的基因表达量，得到的结果为0），下面为一些过程文件的前几行内容，请老师看一下什么原因

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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢

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老师，保留最长转录本之后，提取cds和pep，过程出现这个界面，请问哪里有问题吗？

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老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

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拟时序分析分化方向和实际不相符合