T2T基因组组装 - 组学大讲堂问答社区

T2T基因组组装

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tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存

青春无悔 2025-09-09 10:23:27

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allhic进行染色体挂载，分组过程k=20，只分了一个组出了

青春无悔 2025-08-29 17:12:42

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T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

青春无悔 2025-08-25 15:12:16

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tgsgapcloser报错

陈黑手 2025-06-03 21:52:01