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老师我一个一个步骤进行，一个基因一个基因分析，是这个命令有问题才出现domain_final.bed只有一个基因，代码有问题么:grep -v '#' ZS11.v10.FAE1_hmmerOut.final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >ZS11.v10.domain_final.bed,这是我刚刚使用的这步的代码，前一步产生的hmmerOut.final.txt文件还整常

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老师，我做PAV分析时，“提取物种间泛基因编号相同的基因为同一基因”，这一步时产生的“maize.PHYgene.pan-genes.list”，只有几个基因，其他文件都正常，这是怎么回事

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老师您好，我在做物种间多线性分析时出现如下错误，希望您可以帮忙给看看，感谢！

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老师您好，我做MCScanX 进行blast建库时总是报错，文件前加上绝对路径也还是报错显示文件不存在

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老师你好。提取cds与pep序列报错显示 no sequence

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您好iqtree2运行的时候报错，“You should increase checkpoint interval from the default 60 seconds”，请问可能是什么问题呢？docker虚拟机CPU：16 core，Memory：64 GB。谢谢！

  • 2025-07-05 22:26
1 解决

蛋白3D结构预测

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绘制热图所用数据的样本或处理如何确定

  • 2025-05-23 15:37
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基因家族分析

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想获得某个染色体序列，命令是啥？

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蛋白3D结构预测

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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

  • Max 2025-07-09 17:50
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老师 就是我在做比较基因分析的时候生成的bed文件是空的 这是什么问题呀

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老师，我要做泛基因家族分析中泛基因列表构建，我是不是只需要把data数据的基因组和gff文件链接过去，不用再建文件夹下载了，然后一步步做Rstudio的操作么，我需要下载pangenlist里面的哪些文件到自己的服务器？

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在进行进化树分析时，运行出clean.sorted.vcf.gz文件后，后续文件跑不出来了，报错原因如图所示

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泛基因筛选最长转录本时出现问题

  • Yang 2025-07-03 22:25
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老师，我手动生成了domain_final.bed，但是出现了以下情况，检查了相关文件都能打开，我是做成和share文件里domain_final.bed一样的txt格式，然后在FZ上加后缀bed改为bed格式，请问哪里有问题

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windows安装Aspera Connect软件

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老师您好，我做比较基因组时，orthofinder2运行时出现报错，这是什么原因？该如何解决。请老师解答

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Error, no sequence for chr1 at xxxxxxxxxxxxxxx/util/gff3_file_to_proteins.pl line 82.