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有两个基因不在染色体上在contig上，为什么会这样，图片里的contig可以删掉吗，会有什么影响吗

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想问一下，为什么我用pfam筛选，结果出来是这样的，没有能看结果的地方，也没有能下载的地方

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按照课程输入命令，但是报错显示没有这个命令

  • zjc 2025-04-23 11:14
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宏基因组得到的物种相对丰度表进行kw差异分析或者Lefse分析时，对数据提前进行对数处理合理吗

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老师您好，分析SNP和INDEL时报错，请解答。

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为啥我搜不到镜像啊

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老师，在泛基因家族分析结构变异的基因注释中，提取vcf文件有用信息列，$14是哪个

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braker注释结果有问题

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IBD 计算2

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求老师解答，docker run 出错

  • Oho 2025-04-20 11:38
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老师，我现在在学习泛基因组分析，研究物种是梨；现已找到13个基因组，那我在基因家族鉴定的时候用13个基因组；而泛基因集的构建我需要选择几个？

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pav分析，在写文章的时候应该如何写怎么到PAV呢？我是通过课程输入代码来的，写文章怎么写呢？

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卸载重装后docker后为啥docker pull omicsclass/organelle-assembly:v1.0怎么下载不了这个镜像了

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下载VirtualBox，显示 安装时发生严重错误 是为啥啊？

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ParaAT批量比对出现问题，这个是怎么回事？

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泛基因家族鉴定-找不到Bio::SeqIO模块

  • Q_C 2025-04-16 13:28
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在进行GWAS的LDBlock可视化中，在Win11本地的Docker执行LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region Chr1:36000000-37000000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt -PointSize 0.8命令时，程序居然报错UnKnow argument -PointSize，请问这是怎么回事呢，如何解决呢？请组学大讲堂的老师麻烦回答一下！谢谢！

  • John 2025-03-12 16:57
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5 老师您好，我在运行megahit对200多个环境微生物宏基因组数据进行组装时，megahit报错Exit code -9

  • Zz1 2025-05-27 10:13
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单细胞测序数据两个子集合并

  • Zzz 2025-04-27 17:18
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Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F $FAI -T Sugar_$m -n Sugar_${m}_manhattan -c 1.3e-6绘制曼哈顿图时，输入这段代码后，报错，显示颜色数量不足，怎么解决