1 回答

lefse分析细节

1 回答

老师，我想做一下分子方差分析AMOVA，咱们有相关的代码嘛，好多群体遗传文献里有这个分析，不知道咱们可以提供嘛？

1 回答

hmmsearch --domtblout ./${ind}.WRKY_hmmerOut.txt --cut_tc ./WRKY.hmm ./${ind}.gene.pep.fasta;;我有两个结构域，需要如何更改呢？

1 回答

老师，想问一下meme.html怎么在网页中打开呢？

1 回答

老师，保留最长转录本之后，提取cds和pep，过程出现这个界面，请问哪里有问题吗？

1 解决

老师，我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令；视频中data数据中为gff的后缀，我的数据是gff3的，把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗？

0 回答

运行hmmsearch返回结果为空，后来再试时报错

1 回答

老师您好，我在进行megahit组装后运行quast.py这段出现报错，查看megahit.log文件后，出现的最后一行command的信息为Exit code -15,请问这是怎么回事呢？

0 回答

二代DNA测序数据进行kmer分析，结果如下图，想请问可能的原因和建议。

1 回答

老师我在构建泛基因列表，合成last.txt文件，结果只有两列

1 回答

老师，我有20个不同菌株的基因序列（fasta文件），请问怎么进行基因组学分析？

  • 2025-02-23 13:46
1 回答

老师，我在构建泛基因列表时，做cat pangene_filter.*lifted.anchors | grep -v "^#" | awk '{print $1"\t"$2}'> ../03.jcvi-pan-vs-genome/syn.txt这一步，找不到pangene_filter.*lifted.anchors 是怎么回事

1 回答

请问可以同时运行2个terminal吗，在内存和存储还有cpu都有剩余很多的情况下

0 回答

老师，保留最长转录本中，过程文件出现了take into account

0 回答

想问一下，为什么我用pfam筛选，结果出来是这样的，没有能看结果的地方，也没有能下载的地方

1 回答

请问这2个sam文件对后续有什么帮助吗 占用内存太大 想删掉 不知道有没有用

2 回答

老师您好，在参考基因组比对时出错。

2 回答

请问这个是中间文件吗，注释成功后，就可以删除掉，节约空间，是吗？

2 回答

老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛基因编号文件和泛基因列表一样，不知道为什么

0 回答

RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节出现以下问题