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泛基因家族分析-SV和基因表达量

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泛基因集执行命令时，由syn.txt文件到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时会丢失一些基因吗？我做自己的物种分析时发现丢失了一些基因，是什么原因？这正常吗

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老师请问一下。我在练习基因组组装中因为磁盘空间不够想删除一些中间文件，查看了磁盘空间，请问应该删除哪一个并且如何删除呢

  • Nier 2025-10-11 10:37
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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因家族分析-SV和表达量

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老师您可以分享一下buildRepeatSummary.pl脚本嘛

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泛基因家族分析-SV和表达量

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deepTE.py报错

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对代谢数据的黄酮和酚酸与转录组进行WGCNA分析，如何准备文件？

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VCF文件按照指定的染色体排序

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组学大讲堂的一个T2T组装培训课，在进行组装前先除去了和细胞器DNA高度相关的reads。但是我看现在大部分的文章没有特别处理细胞器的DNA，是在组装的过程中已经被除掉了吗？

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在全基因组选择育种课程中，所有需要预测的样本（在 pred_ID.csv 中列出的ID），必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中，是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分？我需要预测新的群体，那这 pred_ID.csv文件该如何编写？

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5 进行宏基因组分析组装这一部分，比对 reads，生成未比对 BAM 文件时很慢

  • 2025-10-10 20:38
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请问各位老师有没有像用脚本buildSummary.pl统计out文件一样的可以用于统计gff格式重复序列注释文件的脚本？

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借助转录组辅助基因组注释

  • _He. 2025-10-19 23:21
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Xpclr

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10 基因家族只有2个基因，可以做共线性分析吗，想检测一下有无复制基因对

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老师请问一下我在做hic挂载练习的时候运行到使用bwa的aln和sampe进行比对，这里问什么不运用mem这个功能进行比对呢

  • Nier 2025-10-17 16:36
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泛基因家族分析PAV_gene.list中基因数量，少于gene.pep.fa中序列的数目

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smooth.value