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老师，想问一下您，用blastp方法做基因家族成员鉴定时，鉴定到了51个成员，其中有几个成员的蛋白序列相似性大于98%，但是位于不同染色体上，这种是否需要删除多余的，只保留一条就够了？

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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

  • Max 2025-07-09 17:50
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老师您好，在做比较基因组提取CDS、蛋白序列和最长转录本时候，提取出的文件是空的，这是什么原因，请老师解惑

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GATK 将VCF文件导入db出现问题

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老师，我手动生成了domain_final.bed，但是出现了以下情况，检查了相关文件都能打开，我是做成和share文件里domain_final.bed一样的txt格式，然后在FZ上加后缀bed改为bed格式，请问哪里有问题

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基因组组装BUSCO多拷贝过高

  • 2025-09-17 09:25
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5 mummer比对syri进行SV检测报错

1 解决

泛基因家族分析数据准备

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老师您好，我做MCScanX 进行blast建库时总是报错，文件前加上绝对路径也还是报错显示文件不存在

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在进行进化树分析时，运行出clean.sorted.vcf.gz文件后，后续文件跑不出来了，报错原因如图所示

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老师您好，我在做物种间多线性分析时出现如下错误，希望您可以帮忙给看看，感谢！

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基因家族分析

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allhic进行染色体挂载，分组过程k=20，只分了一个组出了

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老师您好，进行比较基因组分析时候，在第一步数据处理，保留编码蛋白基因，及最长转录本时，出现报错，这个对后续分析有影响嘛

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老师我这次{ind}.FAE1_hmmerOut.final.txt都只有一个了，list文件正常，前一步生成的{ind}.FAE1gene.pep.fa也正常，这该怎么办

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老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

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泛基因组分析，磁盘配额不足

  • Yang 2025-07-26 16:31
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GATK 分染色体CALL变异之后怎样合并

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基因家族分析

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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？