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4天前 回答问题

在进行聚类分析时，如何将自己的tsv文件生成qs文件

TSV文件里没有stim分组，有DZ_1、DZ_2、SZ_1、SZ_2，这个没注意到，tsv转qs我是在Miniforge Prompt里用R语言转换的

4天前 发起提问

在进行聚类分析时，如何将自己的tsv文件生成qs文件

2026-04-22 16:08 发起提问

转录组代谢组联合分析时，绘制CCA图时代码meta_cca_forward_pr.site <- data.frame(meta_cca_forward_pr.scaling1$sites)[1:2]报错，错误于`[.data.frame`(data.fr

2025-12-04 13:54 发起提问

提供感兴趣基因进行分支分析时，出现Error in simple_vs_index(x, rlang::eval_tidy(args[[1]]), na_ok) : Unknown vertex selected报错

2025-12-02 19:54 发起提问

轨迹分析出现killed报错

2025-12-01 21:24 发起提问

本地镜像代码运行不了

2025-09-25 14:54 回答问题

老师，拟时序基础初步分析时，运行以下代码时Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../04.cell_type_ann_leaf/leaf.added.celltype.qs \ --use

2025-09-24 18:48 发起提问

老师，图1是我用图2的代码实现的，现在我想仿照提取细胞亚类的方式，使用图3的代码单独提取TIP这个maker基因，不提取整个cluster3，这个代码可以实现吗，或者是否有其他代码可以使用

2025-09-19 16:51 发起提问

老师，在初步查看cluster分群信息时，能否使用--cols代码，实现对某个cluster的颜色进行改变，具体代码是什么

2025-09-10 11:39 发起提问

老师，拟时序基础初步分析时，运行以下代码时Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../04.cell_type_ann_leaf/leaf.added.celltype.qs \ --use