常见的植物数据库(更新-Ing)

常见植物基因组数据库

转录组扫盲篇

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA、非编码RNA以及小RNA等,不过咱们常说的转录组或者RNA-seq,一般是指狭义上的“转...

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  • 红橙子
  • 发布于 2019-03-20 14:34
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如何批量分析蛋白序列domain-SMART数据库

SMART批量进行蛋白质序列domain搜索

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  • Daitoue
  • 发布于 2019-01-18 10:38
  • 阅读 ( 46170 )

FigTree进化树批量修改ID

FigTree批量修改ID

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  • Daitoue
  • 发布于 2019-01-17 09:41
  • 阅读 ( 14517 )

Perl 入门 之 context 标量上下文与列表上下文

Perl 入门 之 context 标量上下文与列表上下文

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-12-24 16:47
  • 阅读 ( 3596 )

轻松搞定iTOL注释文件

轻松搞定iTOL注释文件

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  • 安生水
  • 发布于 2018-12-14 15:21
  • 阅读 ( 18524 )

iTOL修改进化树的标签基因ID名称

iTOL如何修改标签

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  • 安生水
  • 发布于 2018-12-07 10:32
  • 阅读 ( 18407 )

linux命令之AWK

linux命令之AWK

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-11-27 17:35
  • 阅读 ( 4206 )

Cox生存分析中Risk Score 的计算

Cox生存分析中Risk Score 的计算

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  • microRNA
  • 发布于 2018-11-09 14:37
  • 阅读 ( 19357 )

Adobe Illustrator 无法加载次应用程序的本地化资源文件

Adobe Illustrator 无法加载次应用程序的本地化资源文件 可以通过右键选择“管理员身份运行” 后能正常使用

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-29 09:27
  • 阅读 ( 8815 )

cutree对pheatmap返回结果实现聚类cluster划分

此前给大家介绍过pheatmap聚类后的矩阵数据重排:http://www.omicsclass.com/article/507 其中给大家介绍到了pheatmap返回结果是一个列表,其中包括行列聚类的返回结果,而这一结果又是基于hcl...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-19 14:53
  • 阅读 ( 17350 )

blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明(blast+ m6格式)

blast 结果说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-10-19 12:06
  • 阅读 ( 14462 )

bedtools求交集

bedtools求交集 其用法: bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式,至少三列,分别...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-19 11:30
  • 阅读 ( 8027 )

iTOL绘制好看的系统发育树

系统发育树也称为系统发生树、聚类树或者进化树。它以树状结构表示各个节点的进化和亲缘关系,枝点可以是物种和基因等,在系统发育分析、基因家族和物种进化分析中经常会看到此类图片。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-09-07 14:26
  • 阅读 ( 28456 )

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

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  • microRNA
  • 发布于 2018-08-03 10:54
  • 阅读 ( 21271 )

做韦恩图?自己搞定!

韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具,简单易学!

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-26 11:08
  • 阅读 ( 30238 )

Rstudio 防止中文乱码(保存与显示)

为了防止代码文件出现中文乱码,一般在Rstudio中,都要求将文件保存为UTF-8格式,同时打开显示也要求以UTF-8格式进行显示,相应的设置方法如下: 保存文件: 进入Tools——Global Options,选...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-17 11:57
  • 阅读 ( 20863 )

转录组测序样品间的相关性有何意义?如何计算?

样品间的相关性反应了样品间的相似程度,即不同处理或组织的样品在表达水平方面的相似度。相关系数越 接近1,样品间的相似度越高,样品间的差异基因也越少。生物学重复间的样品的相关系数...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 14:02
  • 阅读 ( 13858 )

MEGA构建进化树遇到报错信息

最近又有人遇到mega构建进化树时报错,所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 14:21
  • 阅读 ( 39214 )

endnote 如何插入书籍引用

endnote引用书籍的章节。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 13:43
  • 阅读 ( 36203 )