茶树在非生物胁迫下的转录响应

非生物胁迫下耐受性植物 转录组实验的典型研究思路。

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 21:49
  • 阅读 ( 2964 )

RNA-seq发文必备技能——GEO数据库上传

使用转录组数据发文章必备技能——教你轻松搞定GEO数据上传。

  • 1
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 21:44
  • 阅读 ( 10952 )

做进化树,到底哪种算法适合我?

进化树(英语:phylogenetic tree)又称演化树(evolutionary tree),是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树状图。是一种亲缘分支分类方法(cladogram)。在图中,每个节点代表其...

  • 1
  • 0
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 20:56
  • 阅读 ( 4719 )

病毒衍生的small RNAs: 宿主与病毒互作的分子“证据”

    病毒是专性寄生,需要借助宿主才能进行复制,繁殖。在病毒的复制循环过程中,其RNA中间体可以被宿主的不同抗病毒途径RNA decay、RNA interference、 and RNase L pathways识别并降解,从而...

  • 0
  • 0
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 18:12
  • 阅读 ( 2720 )

低成本转录组跨种遗传进化分析

金蕨属转录组遗传进化分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:52
  • 阅读 ( 4281 )

二代测序原理

illumina 边合成边测序,理解测序原理对后续数据分析很有帮助。

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:40
  • 阅读 ( 2865 )

sci-hub文献下载网站

学术界的“盗版女王”,哈萨克斯坦研究生兼女黑客亚历山德拉·埃尔巴克彦。文末附可用链接,再也不用担心下载不到文章了。

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:26
  • 阅读 ( 2945 )

同是转录组,人家发6分,你为什么发2分?

转录组文章,你这样分析数据也能发6分的。

  • 1
  • 0
  • 红橙子
  • 发布于 2018-04-22 12:31
  • 阅读 ( 3458 )

一大波三代文章正在来袭!有没有你滴?

三代测序方兴未艾,文章产出高,快来感受下吧!

  • 0
  • 0
  • 红橙子
  • 发布于 2018-04-22 12:23
  • 阅读 ( 3172 )

三代转录组,当前你不可忽视的研究手段

三代转录组几大法宝:全长转录本、鉴定异构体(Isoforms)、鉴定可变剪接、鉴定基因融合,长读长带来二代测序不可比拟的优势!

  • 1
  • 0
  • 红橙子
  • 发布于 2018-04-22 12:11
  • 阅读 ( 3592 )

RNA测序阐释大豆产量调控网络和关键基因

研究方法: 1.选用两种种子大小有明显差异的大豆品种,分别在结种(S1)、种子生长(S2)和早期成熟(S3)三个阶段取样。 2.收集并处理S1时期的种子,使用显微镜观察这个时期两种大豆种子的特征。...

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 11:16
  • 阅读 ( 1727 )

RNA测序阐释大豆产量调控网络和关键基因

研究方法: 1.选用两种种子大小有明显差异的大豆品种,分别在结种(S1)、种子生长(S2)和早期成熟(S3)三个阶段取样。 2.收集并处理S1时期的种子,使用显微镜观察这个时期两种大豆种子的特征。...

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 11:15
  • 阅读 ( 2063 )

一条命令能解决多少数据处理问题?

继Linux生信入门,我们又出新课程啦!本期课程我们讲的是Linux命令的使用及怎么用来处理生物数据。

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 11:11
  • 阅读 ( 1574 )

Java安装与配置

由于很多生物学软件都是基于Java开发的,因此想要使用这类软件就必须有Java的运行环境。今天小编就给大家介绍如何在Windows上安装Java。

  • 2
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 11:07
  • 阅读 ( 3463 )

轻松搞定fasta索引文件、序列提取

fasta是常用的序列存储格式,很多软件(如GATK、IGV等)在导入序列以及进行快速查找时通常需要建立索引文件。本文介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。

  • 1
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 11:05
  • 阅读 ( 8102 )

这种机器学习算法已经在微生物分析中成功应用

《Nature》发文证明了某种机器学习算法能够对微生物群落样本进行有效且准确的分类,并且可以找出能够区分组间差异的关键成分(OTU或物种)。本文介绍了该算法的实现形式和应用。

  • 1
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 10:58
  • 阅读 ( 4423 )

怎么做一张好看的分类学树状图

在做微生物多样性分析时,经常会接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn,用它生成的图会更好看哦!

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 10:55
  • 阅读 ( 6009 )

跨物种进化研究必备的‘单拷贝直系同源基因’如何查找

例用Orthomcl查找同源基因,并最终找到单拷贝的直系同源基因。

  • 2
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 10:51
  • 阅读 ( 12409 )

鉴定组装植物病毒——系统详尽的植物病毒学!

一本系统详尽讲述植物病毒的书-Plant Virology Protocols(文末有获取方式),堪称病毒学研究里程碑式巨制。主要内容是如何鉴定组装植物病毒!

  • 0
  • 0
  • 红橙子
  • 发布于 2018-04-21 22:56
  • 阅读 ( 3401 )

做基因定位?大家可能忽略了这个最熟悉的技术

用测序做基因定位,重测序和简化测序一定会首先映入大家的脑海。有一个我们最熟悉的测序产品反而不那么显眼了,其实转录组也是可以用来做基因定位的,而且效果还不错哦!

  • 1
  • 0
  • microRNA
  • 发布于 2018-04-21 22:52
  • 阅读 ( 4237 )