cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2
Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。
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- rzx
- 发布于 2024-04-30 17:41
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rzx
在Windows系统中安装并使用seqkit工具
seqkit软件介绍： Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。 下载链接：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式： 1. 点...
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- rzx
- 发布于 2024-03-19 17:01
- 阅读 ( 3652 )
每天学习一点点
Orthofinder-构建物种系统发育树(Phylogenetic tree)
在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍，这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树（Phylogenetic tree）。 在Orthofinder结果文件中有一...
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- rzx
- 发布于 2023-06-15 17:33
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Minimap2安装与使用
minimap2是生信大牛Heng Li在2018年发表的三代序列比对工具。与传统的bwa相比，Minimap2可以用于三代测序， 也支持 splicing awared 比对；与一些传统三代比对工具相比，Minimap2 速度非常快，...
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- 星莓
- 发布于 2023-05-12 11:07
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星莓
从fasta基因组中提取反向互补序列
从fasta基因组中提取反向互补序列，借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件 -bed 基因位置 共6列：【染色...
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- rzx
- 发布于 2023-02-27 14:22
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叶绿体基因组四个区边界作图——irscope：本地化及使用教程（2023.02）
大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构，即由LSC、SSC以及一对IR区域构成，IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比...
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- 星莓
- 发布于 2023-02-15 15:53
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安生水
MISA(在线)注释叶绿体基因组SSR
SSR (Simple Sequence Repeat)，即简单重复序列，是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术，也称为微卫星序列或者串联重复。
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- 星莓
- 发布于 2023-02-06 11:04
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启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库！
基因结构有很多概念，经常会把我们绕晕，之前小编给大家整理过mRNA、CDS、ORF等概念知识（感兴趣的点击查看：CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清）；今天我们再补充一些概念性知识及着重说下启动子以...
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- 红橙子
- 发布于 2020-09-07 09:16
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红橙子
详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息
详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息。
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- 安生水
- 发布于 2018-09-21 13:19
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omicsgene
