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获取UGT家族基因的泛基因编号，运行代码后内容为空

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你好老师，我想请问一下，有没有代码可以计算群体的多态性信息含量PIC值，观察等位基因数A，有效等位基因数Ae啊，ddRAD测序做的分析有限，想增加点分析

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老师您好！我在使用ParaAT是报错，提示Generating homologous group files for alignments: 0，请问这个如何解决？

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泛基因家族分析-数据准备

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重测序

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重测序

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重测问题

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老师您好，做GWAS分析使用GLM模型时，p值为什么都是-0啊？

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老师您好，在做GWAS分析的时候，性状数据不是连续的数字，是0，1这种，这样的数据也可以按照上课讲的流程分析吗？性状数据没有多年数据，在后续的分析步骤中，不定义tassel_trait这个变量可以吗？

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泛基因组核心基因和可变基因长度比较core_pan_gene_compare.r报错

  • Q_C 2024-12-02 18:46
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Doker打不开，显示内存不够，电脑还有100G内存: don't have enough memory

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泛基因家族mkdir文件夹显示已存在，但目录里没有任何内容

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老师，我在分析PSMC时，出现无法查找到染色体名称，fa文件里面的命名是这个样子的，该怎么办啊

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重测序遗传变异过滤

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genome

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大家好啊，新手一枚，请多关照哈

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hmmsearch出现Segmentation fault (core dumped)

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cnvpytor

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cnvpytor 不运行

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老师，就是我把重测序个体分为三组进行SNP扫描，然后把三次扫描的结果进行合并，得到最后的扫描结果，可以这样操作吗，，下面是代码， 或者是有没有可以将其分开进行snp扫描 然后合并的其他方法，还请老师认真帮我解答 谢谢