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10 求助，如何获取基因与mRNA的对应关系？

  • TonY 2019-05-23 16:16
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5 用hmmer提取物种结构域时,结构域文件是空的

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5 全转录组到底能不能测到circRNA？

  • 2019-05-23 14:19
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hmmer网站搜索蛋白序列中的结构域，得到几个domain，但是序列范围重叠。

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请问有没有鉴定CC结构域的paircoil2的脚本或者什么方法鉴定CC结构域

  • 2019-05-23 09:29
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老师你好，我想问一下，我想用其他物种的一条蛋白质序列搜索小麦基因库有没有相似的基因，在Linux中怎么比对？谢谢

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100 blast2go本地化过程中，导入数据库不全，请问老师是哪一个数据库出了问题？我还想要一份无参GO注释的流程或者手册之类的，谢谢

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在基因家族分析构建时出现没有共同的位点的现象，构建不了进化树

  • 2019-05-21 22:01
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在计算KaKS时，发现分别有两个基因出现BUG,not squal,然后换成phy，不能转换成axt和转换后在计算时依然出现not equal的现象求解，结果文件肯定也是空的

  • 2019-05-21 21:25
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5 请问一下，自己找关于基因家族分析的课题有什么注意事项，找家族基因有什么要求？怎样防止和别的文章研究的家族基因相同？

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老师好，在基因家族分析circos制图时，老师的文件是拟南芥的5条染色体，我的物种有9条染色体，请问这个文件需要怎么修改？

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老师，mapchart时为什么会显示位置错误？我把这个基因删了还有下一基因接着显示位置错误，但我看pep或者GFF中它的位置没错啊

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基因家族课堂中circos美化图片课程中，有一个colline_v2.pl，请问下这个脚本在哪？我从第一节课看到后面都没找到。

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10 关于跑ceRNA网络构建时出现的问题

  • 2019-05-20 00:12
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5 请问各位老师，WGCNA分析中没有性状数据，但分析了两份基因表达数据，我想要得到Module-module relationships的图，应该怎样修改这部分打的代码呢？

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需要确认的基因家族结构域的序列太长，PFAM数据库中手动确认结构域时，被提示序列太长，不能搜索，怎么办

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15 R语言处理GEO数据的问题

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顺式作用元件分析分析DNA还是RNA水平？分析时一般提取多长序列？

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什么是顺式作用元件？

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5 手动确认NBS结构域时，在SMRT确认的含NBS结构域的基因数目与已发表文献中的不符