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怎么利用公开的转录组做基因家族的表达分析，还有GEO和SRA的区别是什么？

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请问各位老师 我通过trinity拼接出来的序列，然后rsem定量，结果出现了比对率很高，个别样本80%多，但是基因表达量都很低，箱型图与密度图都是异常，能解释一下原因么

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请问：在做基因家族分析时，只有基因组的fna，和gbff文件，怎么找它的cds和pep呢

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提交基于二代测序的数据组装分析得到的基因组组装数据

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对基因家族里面所有的成员进行kaks计算，而不仅对串联重复基因进行kaks计算有意义吗？

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老师，可不可以把整个基因家族全部基因的算KA ks，计算选择压力

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5 做基因组间共线性时用下面这个命令进行过滤，我想问一下这个命令在写文章的时候怎么描述呢？

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blast比对之后

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GSDS网址定位问题

  • 大k 2020-04-25 22:28
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请问提取基因CDS位置时，用蛋白序列ID（NP开头）无法提取，但是用mRNAID（NM）可以提取？

  • 大k 2020-04-25 22:21
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基因家族鉴定

  • Jan. 2020-04-25 18:54
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求解TCGA生存分析 数据分集createDataPartition错误

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Can't open perl script "script/get_fa_by_id.pl": No such file or directory 老师请问这是什么原因呢？

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您好，我用cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时，参照你们提供的无参 GO注释的demo, 怎么运行不了？请您指教

  • wzg 2020-04-24 23:50
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老师好，请问在做McscanX分析时，从gff提取的geneID与pep.fa文件的ID不一样，无法提取出蛋白序列，那怎么办？

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老师好，请问在做McscanX分析时，从gff提取的geneID与pep.fa文件的ID不一样，无法提取出蛋白序列，那怎么办？

  • 2020-04-24 17:17
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MEGA建树的问题

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MAGE建树问题

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NJ法和ML法建树大大不同

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3 结构域建树