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您好，请问怎样做转录组数据分析？

  • 2020-09-13 18:05
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3 转录组送样细胞固定

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测序公司发来的是组装好的测序结果，其中里面有全基因组的序列（fa格式），这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp，indel，sv等分析呢？

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你好，我这边从GEO数据集中下载下来相应的数据矩阵，发现他的所有Gene Symbol都为空值，想请问一下如何使symbol不为空，感谢大神指教。

  • tutu 2020-09-10 20:39
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6 关于mapman使用过程的问题

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Linux系统上怎么样下载安装docker呀

  • 2020-09-10 15:26
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10 如何将hmmer search到的某一基因家族成员序列拼接成一条完整的序列

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老师，mcscan_seqid里面的逗号改了也还是float divirision by zero 报错。两个bed文件和CDS文件里的染色体ID都对应的。实在找不出来原因!

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老师您好，我想请问MCScanX共线性分析中，那个Desktop中的cmd.txt文件在哪里可以找到啊？

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老师，我的bed文件中的染色体号和seqid文件里的是一致的，但还是报错float divirision by zero

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老师，请问物种间mcscanx绘图报错float division by zero怎么处理。(已经确定两个bed文件和染色体的ID一致对应的)

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老师您好，我在做物种间共线性分析绘图时，显示list index out of range,我检查了准备的bed文件和cds文件没问题。请问这种情况怎么处理?

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mcscan分析删除“.1”的时候报错

  • 荣 2020-09-08 10:56
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请老师推荐一个课程

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老师，我从ncbi上下载月季的基因组测序数据时找不到cds文件，但找到了其他的gff文件，RNA文件，DNA文件，蛋白序列文件 请问有什么方法可以从它们当中提取cds序列吗

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老师，在运行WGCNA代码sft = pickSoftThreshold(datExpr0, powerVector = powers, verbose = 5)，遇到了这种错误Error in { : task 1 failed - "'x' has a zero dimension."，请问是什么原因呢？

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老师您好!在课程里边有两处都讲到串联重复基因，前面一种通过相似性大于0.75计算出来的串联重复基因对，后边一种通过McscanX计算出来串联重复基因对请问两种方法都需要进行吗?

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老师您好!请问在计算基因家族ka/ks时，是所有的重复基因对（包括串联重复，片度复制，同源基因）都要进行计算吗，还是仅计算串联重复基因对一种

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您好老师，在用stringtie时提示这种错误是因为什么原因啊，应该怎么解决啊？谢谢老师

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老师您好!我在做mcscan分析时blastall出错，显示两个错误，首先是unable to open output file mcscan/ChaShu.blast,第二个是return non-zero status. 请问老师这种情况应该怎么处理呀?