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请教老师mcscanX作图问题
python版mcscan
MCScanX
余生
2020-03-04 12:32
1
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2564
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mcscan/AT.blast文件的生成
MCScanX
Li
2020-03-04 07:47
1
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2877
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求助大佬,想做基因家族分析,目标物种在网上只有三个组装的基因组,JGI上和NCBI其中一个都没有组装到染色体层面,NCBI另一个组装到染色体了,但是没有gff文件和蛋白序列,这种情况应该怎么办?不能做与染色体位置有关的分析了吗?
小明在做游戏
2020-03-04 03:10
1
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1885
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学习有参转录组分析中遇见的问题
转录组有参分析
2020-03-03 23:37
1
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2481
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请问老师这种图用什么软件做的?将不同染色体上的同源基因用相同颜色表示
MCScanX
余生
2020-03-03 17:56
0
回答
1926
浏览
用什么软件来分析IR边界
逸尘缘
2020-03-03 16:27
1
回答
4275
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30
TCGA中比如说我要下病例报告,slide,还有msi怎么下载?
TCGA
TCGAbiolinks
2020-03-03 09:41
1
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4771
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TCGAbiolinks下载“Copy Number Variation”在提取矩阵时报错(在下载miRNA和甲基化数据时也遇到这个问题), expdat变量不是SummarizedExperiment这个类型,导致assay(expdat)不能提取,请问怎么解决
TCGA
TCGAbiolinks
momo
2020-03-03 00:04
1
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4203
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请问老师用转录组分析得出的FPKM值做基因家族的基因表达量热图可以吗?
守得云开雾现。
2020-03-02 22:03
1
回答
5632
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KAKS格式转换
KaKs_Calculator
KaKs
Li
2020-03-02 19:20
1
回答
1878
浏览
请问老师TCGA不同的癌症可以一起分析吗?
maojun9988
2020-03-02 19:17
1
回答
3545
浏览
如何从已知的基因组里对特定通路上的基因进行筛选鉴定?
KEGG
cherish_木
2020-03-02 16:19
1
回答
2488
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关于entrezid问题
小朱大夫
2020-03-02 16:16
1
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2084
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我运行你在有道笔记中的GEO数据库分析遇到问题?
小朱大夫
2020-03-02 15:13
1
回答
1391
浏览
你好,安装好Linux系统后,请问提取氨基酸序列的domain_xulie 的Perl脚本在哪里?
domain_xulei
giroflée
2020-03-02 14:08
1
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1403
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老师,你好,安装好Linux系统后,请问提取氨基酸序列的domain_xulie 的Perl脚本在哪里?在script里没有找到该脚本。
domain_xulei
giroflée
2020-03-02 13:53
1
回答
2051
浏览
请问老师用McscanX做基因组内共线性分析,在准备family.ctl文件时,对染色体编号有撒要求没,我的染色体编号中还有chrA01,chrC01,以及chrA01_random,以及 chrAnn_random,我看有人说染色体编号只能有2个字母加数字,谢谢!
。。。。。
2020-03-02 13:22
3
回答
3025
浏览
$python2 -m jcvi.compara.catalog ortholog ath rapa --cscore=0.7这一步报错
共线性分析
2020-03-02 12:33
1
回答
1798
浏览
老师,做基因组内共共共线性分析出现这种错误的原因是撒原因?
。。。。。
2020-03-02 11:35
1
回答
2799
浏览
老师,我在做hummer搜索时,输入hmmsearch --domtblout ACTS_hmm_out.txt --cut_tc ACTS.hmm proteins.fasta后,
苦行僧
2020-03-01 16:06
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