老师问一下，我现在准备好了我的物种WRKY 蛋白的全长序列和拟南芥的WRKY蛋白全长序列。想仿照菠萝WRKY那篇文献做，但是菠萝那篇文献做多序列比对和进化树都是用WRKY domain 那一段序列做的。我怎么样才能把这些蛋白序列中的WRKY domain 那一段序列挑出来做进化树和多序列比对呢？

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omicsgene - 生物信息
擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

基因家族分析课程里面有脚本可以根据hmmer搜索的结构截取结构域所在的序列：https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

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  • 武汉-怀浩 提出于 2021-09-24 16:18

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