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关于DNase-seq数据分析的问题

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老师好，请问课程bsa分析中，mutmap能同时输入两个子代混池吗？

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老师，您好，我按照课上讲的方法去构建进化树出现了如下图所示的错误，该怎么去解决呢，我把这一行删除了但还是显示有问题

  • Jc 2021-12-27 20:10
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您好，可以把单子叶植物Ka/Ks突变速率参考文献发给我一下吗？我的邮箱：1316648272@qq.com。万分感谢！

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两个群体的snp-index怎么算？

  • 2021-12-27 16:25
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10 老师，你好！

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基因差异表达分析（DESeq2）

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5 诱变材料，且已自交 6 代，是否可用 QTL-seq 的方法来定位到基因？

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各位老师好，课程BSA分析中，qtlseq能用于自然群体吗？三个混池都是自然群体（白色，紫色，黄色)，能把其中一个当做参考，另外两个作为突变混池吗？

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老师你好，构建进化树16S分析一直出错

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您好，alpha和beta多样性分析sampling-depth 16900如何确定？

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5 扩增子测序分析，qiime1的assign_taxonomy.py命令中，如果用blast方法比对序列，可否修改比对的相似度阈值（比如identity或者similarity）？

  • bugz 2021-12-22 19:03
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gama 射线引起的大片段缺失

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mutmap方法为什么必须要有回交过程？

  • 2021-12-22 10:53
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Bio-Linux输入命令没反应

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请问psi-blast得到的pssm矩阵文件该怎么处理？如何看出两条序列的对情况？？

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基因家族鉴定，利用脚本获取基因的蛋白序列的时候出现如下错误，有的物种获取序列没问题，但是有的物种出现问题，请问老师哪里出了问题

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你好，请问一下，我返回来的数据是公司将双端测序的结果进行拼接、指控后得到的，每个样本只有一条.fq文件，这种如何导入啊？

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做关联分析时能否将颜色的RGB数值组转化成0到1或者-1到1的单个数值？求教！可付费！

2 解决

第一步文件导入qiime2一直出错，按照视频设置好