物种分类树图

 老师您好!我每次进行下图1中物种分类树图时,出现了以下报错,回查了level_tree_sample.py脚本,发现报错出现在第98行(见图2),这行代码我理解的意思应该是从左往右以K_细菌到右依次检索,按类别分组,我回查了文件“5.pick_otu_qiime/pick_de_novo_otus/otu_table_clean_rare.txt”(数据见图3),也看不出有什么问题,不知道是什么原因导致了无法进行分组group
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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

检查你的输入数据,是不是有的行,没有 k__Bacteria,

如果有得话 把他删除试试

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啦啦啦种太阳

是的,根据您的宝贵建议,已经运行成功了,谢谢您专业细致的解答

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  • 啦啦啦种太阳 提出于 2022-06-29 11:52

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