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5 生存分析出现的问题

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5 TCGA数据做完cox生存分析，验证完后，还可以接着做什么后续分析？

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TCGA分析

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老师，我想在TCGA数据库里提取用药相关的临床信息，不知道怎么下载？用别人提供的R需要下载出来的都只有年龄，性别等一些信息。

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TCGA数据库下载基因表达数据TXT文件

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TCGA数据中primary site数据下载

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TCGA数据下载

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5 TCGA中miRNA可以区分5P和3P么？

  • 2019-01-04 12:11
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如何提取biotype_classs.txt

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5 gtf_extra_biotype.pl biotype_classs.txt 的代码

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5 TCGA数据下载的时侯要有biotype_classs.txt

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5 关于lncRNA的转录因子预测

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5 GDC client运行之后直接闪退，显示gdc-client error: too few arguments，这个是什么问题，该怎么解决？求助各位大神

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5 转录因子

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5 老师您好，在跑TCGA生存分析的时候，在进行lapply()的时候一直报错。Error in terms.formula(formula, special, data = data) : ExtractVars里的模型公式不对

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5 在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候，做出如下热图，模块与性状之间的关联特别小，不知道这是因为数据本身引起的还是分析过程中设置的数据不合理？谢谢~

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大神们，请教一个问题，在做ceRNA网络构建的时候，input文件里面已经看到了lncRNA以及mRNA与miRNA都有关系，为什么cityscape运行出来是分离的，再三核对input文件后仍然是这样！如下图

  • 2018-11-07 11:42
1 解决

20 TCGA生存分析课程risk socore问题

  • 2018-10-28 19:32
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5 你好，我想从tcga数据库挖掘mzf1基因在不同肿瘤中表达的具体是哪种剪接变异体，以及mzf1基因的甲基化状态，请问该怎样做

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5 TCGA分析得到的risk score如何用自己的数据进行验证，定量pcr可以吗？