TCGA数据中primary site数据下载

attachments-2019-01-x1iKZxLv5c35d124dace2.jpg如果还是继续用GDCdownload下载数据的话,之前筛选出来的primary site就没有被用到,下载之后还是所有HNSC的表达数据,看了一下GenomicDataCommons这个包里有有一个gdcdata函数,应该是用来下数据的,但是不太会写代码。

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1 个回答

microRNA

你可以下将所有的数据下载下来,之后筛选primary site 对应的样本。 
如何筛选primary site 对应的样本,请参考 https://www.omicsclass.com/article/672 

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