5 在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候,做出如下热图,模块与性状之间的关联特别小,不知道这是因为数据本身引起的还是分析过程中设置的数据不合理?谢谢~

attachments-2018-11-nil4zz0S5be828aa41361.jpgabline(h = 1000000, col = "red")

minModuleSize = 80

MEDissThres = 0.35


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2 个回答

Daitoue

改改相关参数试试,你设置的模块最小也是80,而且相似性不太高1-0.35=0.65,可以尝试调整调整

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张婷婷 

您好,根据您的建议,我修改了相关的参数。abline(h = 800000, col = "red"),minModuleSize = 30,MEDissThres = 0.20,但是出来的模块数量特别多,颜色还是比较浅一些。我想在此基础上减少一下模块的数量,不知道应该继续怎样设置参数?谢谢~以下是这次做出的模块与性状相关的图~attachments-2018-11-5QTvqFZ05be933cb68375.jpg

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