5 TCGA数据做完cox生存分析,验证完后,还可以接着做什么后续分析?


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1 个回答

microRNA

做完生存分析之后,可以获得一个由多个分子构成的预后预测模型。可以针对这些分子做更深入的功能分析,主要包括如下几个方面:

1. 被谁调控: 一般会去研究调控这些基因表达的转录因子(TF),miRNA,甲基化修饰等,可以参考课程《TCGA-转录因子调控》 和 《TCGA-ceRNA调控网络分析

2. 与谁表达模型相近: 这个可以做一下WGCNA分析。可以参考课程《WGCNA-加权基因共表达网络分析

3. 与谁互作:这个可以做一下蛋白互作分析。可以参考课程《TCGA-基因差异表达分析》中的蛋白互作分析。

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