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10 cellchat的netVisual_bubble

  • 2025-03-08 01:40
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单细胞测序数据两个子集合并

  • Zzz 2025-04-27 17:18
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KEGG富集分析

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有关于GSEA富集分析参数设置

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使用monocle3进行轨迹分析报错

  • Zzz 2025-04-27 16:56
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3 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

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5 could not find function "newCountDataSet"运行deseq_analysis.r这个脚本报错

  • 荣 2024-12-12 16:45
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单细胞测序FindAllmarkers

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SoupX去除污染RNA

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单细胞测序使用subset脚本提出子集，再进行拟时分析报错plot_genes_by_group

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节出现以下问题

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eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析这一环节出现一些问题，ggplot版本问题

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转录组mfuzz分析问题

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RNA-SEQ有参转录组的课程，可以来分析全转录组数据吗

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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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5 单细胞测序拟时分析没有“seruat”这个包报错

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20 GFF文件格式不标准

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5 原核生物建立基因组索引出现问题，没有gtf在文件

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docker search 出现错误是怎么回事