基因家族分析-家族成员鉴定-下,gff3中mrna的ID号比pep中的多一个后缀怎么删除?

attachments-2022-05-1Wrz3nXw627cb49595309.png这两个文件是可以做出来的attachments-2022-05-x6mD6L1r627cb4438013f.png在这一步的时候我的gff3文件中mRNA,CDS,ID号是有后缀的(mRNA中多一个后缀为t1或者t2、t3,CDS中多了CDS1、2、3之类的),pep文件中没有这些后缀,导致这一步代码做出来的文件只是一行基因名称,并没有mRNA的ID号,想问问老师这个后缀怎么去除

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

notepad++  打开GFF文件搜索替换一下就行;

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夏晚迎风

谢谢 我有点明白了 我去试试


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  • 蒋福红 提出于 2022-05-11 18:31

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