MarkDuplicates (GATK)报错:打开的文件句柄过多(Too many open files)

使用GATK对bam文件进行去重操作的时候发现报错了

Rna-seq 去除批次效应ComBat-seq

ComBat-seq

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  • 发布于 2024-01-09 10:54
  • 阅读 ( 548 )

RNA分类

RNA分类

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  • rzx
  • 发布于 2023-10-17 17:54
  • 阅读 ( 430 )

有参转录组数据分析镜像升级v2.0

有参转录组数据分析镜像升级v2.0

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  • 发布于 2023-10-09 11:54
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blastp 快速比对注释基因,输出注释信息

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...

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  • 发布于 2022-11-21 16:35
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eggNOG 注注释报near "WITHOUT": syntax error

eggnog-mapper 注释

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  • 发布于 2022-11-16 15:44
  • 阅读 ( 1112 )

loom 文件转换成Seurat对象

loom 文件转换成Seurat对象

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  • 发布于 2022-06-24 22:43
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Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

Infercnv|单细胞转录组拷贝数分析

Infercnv|单细胞转录组拷贝数分析

cellphoneDB|单细胞分析之细胞间通讯分析

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单细胞转录组测序简介

单细胞转录组测序简介

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  • 发布于 2022-05-26 09:38
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从原始测序数据开始分析单细胞数据

umi tools

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  • 发布于 2022-02-10 13:51
  • 阅读 ( 1738 )

NBT同时两篇文章:单细胞数据分析流程 比较

单细胞数据分析流程 比较

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  • 发布于 2022-01-24 11:36
  • 阅读 ( 1206 )

R包hdf5r安装失败 SeuratDisk 安装失败

R包hdf5r安装失败 SeuratDisk 安装失败

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  • 发布于 2022-01-22 10:23
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外显子比对率太低,参考基因组索引建立refFlat.txt文件有问题:

转录组索引

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  • 发布于 2022-01-13 09:57
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EggNOG基因序列批量注释

介绍EGGnog数据库批量注释基因

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  • 发布于 2021-10-09 12:08
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SNP分析中由于基因组序列过长导致报错解决方法

SNP分析中由于基因组序列过长导致报错解决方法

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  • 发布于 2021-09-17 16:11
  • 阅读 ( 3590 )

DEG_limma.R 差异基因分析limma

DEG_limma.R 差异基因分析limma

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  • 发布于 2021-07-29 10:41
  • 阅读 ( 2073 )

clusterProfiler非模式物种 KEGG与GO富集分析

非模式物种 KEGG与GO富集分析

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  • 发布于 2021-06-30 15:21
  • 阅读 ( 10490 )

edger_analysis.r 差异基因分析edgeR

edger_analysis.r 差异基因分析edgeR

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  • 发布于 2021-06-25 11:21
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