microRNA
手把手教你使用GSEA分析！
准备好分析需要的文件，在GSEA官网下载分析软件（软件可以免费下载，需要配置java环境）就可以进行GSEA分析。 打开分析软件，第一步是载入数据，如下图所示，点击红箭头指向的1出的Load data会...
- 2
- 0
- landy
- 发布于 2018-07-06 12:53
- 阅读 ( 9344 )
landy
统计不同样品-生物学重复基因表达量数据合并和绘图统计
处理统计RNA-seq 表达量数据，绘制柱状图，PCA散点图，还有不同样品表达基因维恩图。
- 1
- 0
- omicsgene
- 发布于 2018-06-28 23:52
- 阅读 ( 10453 )
omicsgene
转录组分析时，影响差异基因数量的因素有哪些？
差异基因的筛选是基于统计学意义的，不能直观的通过两个数值的大小判断差异基因的是否。 首先：受测序深度的影响，有些样品的测序深度较深，可能导致该样品的readcount数值较高，做差...
- 0
- 0
- landy
- 发布于 2018-06-28 16:33
- 阅读 ( 8683 )
Cufflinks,Stringtie 合并转录本之后，如何筛选新转录本？
GTF文件中class code 注释转录本的类型
- 0
- 0
- microRNA
- 发布于 2018-06-28 09:51
- 阅读 ( 6512 )
GSEA分析需要的基因集Molecular Signatures Database是什么？
在作GSEA的分析时候需要提供一个预先定义好的基因集，用来评估基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势，从而判断其对表型的影响作用，那么基因集都包括哪些呢？ GSEA官网的基因集...
- 0
- 0
- landy
- 发布于 2018-05-31 16:03
- 阅读 ( 9115 )
红橙子
病毒衍生的small RNAs： 宿主与病毒互作的分子“证据”
病毒是专性寄生，需要借助宿主才能进行复制，繁殖。在病毒的复制循环过程中，其RNA中间体可以被宿主的不同抗病毒途径RNA decay、RNA interference、 and RNase L pathways识别并降解，从而...
- 0
- 0
- landy
- 发布于 2018-04-22 18:12
- 阅读 ( 2721 )
三代转录组，当前你不可忽视的研究手段
三代转录组几大法宝：全长转录本、鉴定异构体（Isoforms）、鉴定可变剪接、鉴定基因融合，长读长带来二代测序不可比拟的优势！
- 1
- 0
- 红橙子
- 发布于 2018-04-22 12:11
- 阅读 ( 3592 )
做基因定位？大家可能忽略了这个最熟悉的技术
用测序做基因定位，重测序和简化测序一定会首先映入大家的脑海。有一个我们最熟悉的测序产品反而不那么显眼了，其实转录组也是可以用来做基因定位的，而且效果还不错哦！
- 1
- 0
- microRNA
- 发布于 2018-04-21 22:52
- 阅读 ( 4237 )
