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老师您好,我根据您的方法从GFF信息,从基因组里提取基因的蛋白序列和 cds序列,但是显示command not found,请您看看是怎么回事呢?上面写的代码要在分析镜像2.0中进行,但是课程给我们的只有v1.0.1,不知道是不是这个原因呢?
蛋卷儿〜
2023-04-06 22:28
0
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538
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motif展示
夏夏夏
2023-04-06 10:02
1
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请问在获取基因与mRNA的对应关系这一步,会出现提示说mRNA没有相对应的gene id 呢,可是文件中有gene id 呢,如图所示,而且输出的mRNAgeneID.txt里也没有转录本信息
蛋卷儿〜
2023-04-05 15:14
1
回答
498
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查看基因组文件里面有哪些信息时,除了CHr还有NSCAFA等其他的,是为什么呢
蛋卷儿〜
2023-04-05 14:17
1
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10
基因家族分析:基因结构
基因结构
yeyeye
2023-03-25 15:04
1
解决
1386
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5
基因家族成员定位在scaffold
基因家族
2023-03-13 14:12
1
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674
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老师好,我在进行染色体定位时,有两个基因显示不能定位到染色体上,这个需要怎么解释?我在后面顺势作用原件一系列的分析中,还需要分析这两个基因吗?麻烦老师解答,谢谢老师。
染色体定位
幸运女神保佑我
2023-03-03 12:07
1
回答
1654
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5
基因家族成员鉴定cdd
基因家族
2023-02-28 15:24
0
回答
532
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老师好,我在使用samtools进行染色体长度获取时出现了这种报错。此物种的gff3文件没有具体的染色体长度注释,以及使用基因组染色体的fasta文件进行统计的话数据很多,工作量很大,麻烦老师帮忙看看怎么解决这个问题。谢谢老师!
染色体位置图
幸运女神保佑我
2023-02-27 13:06
1
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756
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想请教一下各位老师,做基因家族共线性分析的时候,出现这种情况是什么原因
大橙子
2023-02-16 16:53
1
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534
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kaks批量提取报错
Orange_flame
2023-02-16 15:08
1
回答
776
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5
基因家族分析---没有蛋白序列可以做基因家族分析吗?
2023-02-15 17:40
2
回答
1128
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基因家族物种间共线性,老师,为什么我的物种间共线性分析总是报错,我检查了文件格式他还是报错。 我用这个物种的文件vs这个物种的文件就可以得到结果,两个不同的就没有结果,文件应该没有问题。这是为什么呀老师?(下面的图片也是同一个物种,但是不是同一个网站的数据)
物种间共线性
python版mcscan
2211130014
2023-02-14 14:38
1
回答
521
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基因家族分析
木瓜娃子
2023-02-12 18:48
1
回答
601
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如何获取顺势作用原件分析的gene.bed和feature.bed文件
Orange_flame
2023-02-09 18:27
1
回答
762
浏览
5
基因家族分析
zzzzz
2023-01-29 12:23
1
回答
571
浏览
请问PSI-blast 搜索不到结果是什么原因呢
爱学习的可里
2023-01-28 14:21
2
回答
1171
浏览
共线性分析时,导出的文件WRKY.collinear.pairs出现这样怎么回事,运行过程中没有报错
MCScanX
追梦
2023-01-12 13:47
1
回答
691
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OrthoVenn2打不开
XKCai
2023-01-10 23:25
2
回答
1276
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比较基因组学 关于绘制3个以上的物种基因家族进化与同源关系(mcscan python版本)
比较基因组学
python版mcscan
小夭
2023-01-09 16:18
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