5 基因家族成员鉴定cdd

老师,您好!我做的是mapk,这个家族有3个激酶,用hmm鉴定出来有500多个,可是文献里鉴定出来的是14个左右,想问一下筛选的cdd条件怎么确定呢?使用STKc_MAPK作为筛选条件只有3个,STKc_MAP作为筛选有7个,以STKc作为筛选有163个,我查阅了文献,他们的筛选方法是保证有STK,丝氨酸和组氨酸的这个基序在。所以有些搞不清楚

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

数量相差这么多,你检查一下方法是不是有问题,

或者再了解了解你家族特征吧

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