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为什么orthofinder分析基因家族时候一个基因也算一个基因家族？

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请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊，然后我又把名字改成不一样的，让他不能过滤掉重复序列，之后生成的就和之前的一样了，是什么回事

  • 李 2024-01-11 11:07
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在做多物种共线性分析是出现输出空文件是什么情况

  • 李 2024-01-11 10:16
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docker发生错误

  • nuli 2024-01-09 22:30
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保留蛋白编码基因代码出错——3

  • nuli 2024-01-09 10:50
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保留蛋白编码基因代码出错——2

  • nuli 2024-01-09 09:45
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保留蛋白编码基因代码出错

  • nuli 2024-01-09 09:37
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基因家族分析-基因结构

  • nuli 2024-01-07 14:56
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基因家族建树

  • nuli 2024-01-07 10:10
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如何合并两个提取好的两个保守结构域的序列

  • nuli 2024-01-06 11:27
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一个酶基因家族里边具有两个结构域

  • nuli 2024-01-06 09:12
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pfam选择

  • nuli 2024-01-05 16:45
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请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊

  • 李 2024-01-05 15:36
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hummersearch命令出错-2

  • nuli 2024-01-05 11:57
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基因家族鉴定数据准备

  • nuli 2024-01-05 11:47
1 回答

hmmersearch命令出错

  • nuli 2024-01-05 10:42
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docker 基因家族鉴定提取CDS序列 命令报错

  • nuli 2024-01-04 20:37
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在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分开了，请问有什么解决方法吗？老师我看到了这个问题您回答说调整多序列比对结果，具体是怎么调整呢？

1 解决

老师，如果基因家族鉴定出来只有几个，按照HKT那个文献说的也要鉴定其他物种的基因家族，合并结果是合并通过基因家族基因列表对应基因的蛋白序列吗，可以用大讲堂的镜像完成吗，如果可以应该用哪个命令，或者只能自己整理。还有就是应该可以不通过blast的方式鉴定其他家族的基因，也可以重复利用镜像完成hmmer搜索候选的HKT吧

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老师，为什么seqtk在桌面版docker就能运行，换到服务器就不能运行了